Protein–RNA interactions for Protein: P20309

CHRM3, Muscarinic acetylcholine receptor M3, humanhuman

Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRM3P20309 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHRM3P20309 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHRM3P20309 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHRM3P20309 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHRM3P20309 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHRM3P20309 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHRM3P20309 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHRM3P20309 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHRM3P20309 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHRM3P20309 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CHRM3P20309 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHRM3P20309 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHRM3P20309 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHRM3P20309 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHRM3P20309 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CHRM3P20309 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CHRM3P20309 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CHRM3P20309 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CHRM3P20309 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHRM3P20309 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHRM3P20309 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHRM3P20309 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHRM3P20309 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHRM3P20309 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHRM3P20309 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHRM3P20309 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHRM3P20309 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHRM3P20309 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CHRM3P20309 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHRM3P20309 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHRM3P20309 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHRM3P20309 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHRM3P20309 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHRM3P20309 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHRM3P20309 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CHRM3P20309 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHRM3P20309 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHRM3P20309 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHRM3P20309 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHRM3P20309 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CHRM3P20309 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CHRM3P20309 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CHRM3P20309 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CHRM3P20309 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHRM3P20309 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHRM3P20309 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHRM3P20309 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CHRM3P20309 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHRM3P20309 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHRM3P20309 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHRM3P20309 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHRM3P20309 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHRM3P20309 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHRM3P20309 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHRM3P20309 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHRM3P20309 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHRM3P20309 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHRM3P20309 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CHRM3P20309 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CHRM3P20309 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CHRM3P20309 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CHRM3P20309 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CHRM3P20309 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CHRM3P20309 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CHRM3P20309 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHRM3P20309 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHRM3P20309 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHRM3P20309 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHRM3P20309 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHRM3P20309 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CHRM3P20309 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHRM3P20309 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHRM3P20309 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHRM3P20309 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHRM3P20309 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHRM3P20309 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHRM3P20309 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHRM3P20309 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHRM3P20309 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHRM3P20309 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHRM3P20309 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHRM3P20309 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHRM3P20309 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CHRM3P20309 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHRM3P20309 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHRM3P20309 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHRM3P20309 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHRM3P20309 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHRM3P20309 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHRM3P20309 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHRM3P20309 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHRM3P20309 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CHRM3P20309 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHRM3P20309 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHRM3P20309 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHRM3P20309 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHRM3P20309 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHRM3P20309 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHRM3P20309 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHRM3P20309 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72 ms