Protein–RNA interactions for Protein: P17405

SMPD1, Sphingomyelin phosphodiesterase, humanhuman

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPD1P17405 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SMPD1P17405 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
SMPD1P17405 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SMPD1P17405 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SMPD1P17405 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SMPD1P17405 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SMPD1P17405 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SMPD1P17405 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SMPD1P17405 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SMPD1P17405 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SMPD1P17405 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
SMPD1P17405 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SMPD1P17405 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SMPD1P17405 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SMPD1P17405 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SMPD1P17405 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SMPD1P17405 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
SMPD1P17405 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SMPD1P17405 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SMPD1P17405 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SMPD1P17405 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SMPD1P17405 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SMPD1P17405 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SMPD1P17405 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.24
SMPD1P17405 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SMPD1P17405 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SMPD1P17405 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SMPD1P17405 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SMPD1P17405 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SMPD1P17405 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SMPD1P17405 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
SMPD1P17405 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
SMPD1P17405 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SMPD1P17405 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SMPD1P17405 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SMPD1P17405 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SMPD1P17405 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SMPD1P17405 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SMPD1P17405 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SMPD1P17405 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SMPD1P17405 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SMPD1P17405 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SMPD1P17405 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SMPD1P17405 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
SMPD1P17405 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
SMPD1P17405 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SMPD1P17405 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SMPD1P17405 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SMPD1P17405 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SMPD1P17405 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SMPD1P17405 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SMPD1P17405 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SMPD1P17405 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SMPD1P17405 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SMPD1P17405 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SMPD1P17405 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SMPD1P17405 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SMPD1P17405 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SMPD1P17405 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SMPD1P17405 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SMPD1P17405 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SMPD1P17405 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SMPD1P17405 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SMPD1P17405 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SMPD1P17405 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SMPD1P17405 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
SMPD1P17405 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SMPD1P17405 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SMPD1P17405 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SMPD1P17405 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SMPD1P17405 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SMPD1P17405 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SMPD1P17405 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SMPD1P17405 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SMPD1P17405 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SMPD1P17405 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SMPD1P17405 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SMPD1P17405 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SMPD1P17405 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SMPD1P17405 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SMPD1P17405 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
SMPD1P17405 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SMPD1P17405 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SMPD1P17405 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SMPD1P17405 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SMPD1P17405 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
SMPD1P17405 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
SMPD1P17405 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SMPD1P17405 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SMPD1P17405 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SMPD1P17405 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SMPD1P17405 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SMPD1P17405 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
SMPD1P17405 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SMPD1P17405 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SMPD1P17405 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SMPD1P17405 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SMPD1P17405 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SMPD1P17405 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SMPD1P17405 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms