Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
HOXD8P13378 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
HOXD8P13378 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
HOXD8P13378 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
HOXD8P13378 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
HOXD8P13378 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
HOXD8P13378 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
HOXD8P13378 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
HOXD8P13378 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
HOXD8P13378 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
HOXD8P13378 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
HOXD8P13378 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
HOXD8P13378 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
HOXD8P13378 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
HOXD8P13378 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
HOXD8P13378 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
HOXD8P13378 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
HOXD8P13378 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
HOXD8P13378 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
HOXD8P13378 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
HOXD8P13378 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
HOXD8P13378 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
HOXD8P13378 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
HOXD8P13378 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
HOXD8P13378 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
HOXD8P13378 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
HOXD8P13378 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
HOXD8P13378 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
HOXD8P13378 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
HOXD8P13378 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
HOXD8P13378 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
HOXD8P13378 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
HOXD8P13378 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
HOXD8P13378 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
HOXD8P13378 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
HOXD8P13378 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
HOXD8P13378 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
HOXD8P13378 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
HOXD8P13378 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
HOXD8P13378 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
HOXD8P13378 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
HOXD8P13378 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
HOXD8P13378 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
HOXD8P13378 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
HOXD8P13378 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
HOXD8P13378 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
HOXD8P13378 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
HOXD8P13378 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
HOXD8P13378 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
HOXD8P13378 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
HOXD8P13378 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
HOXD8P13378 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
HOXD8P13378 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
HOXD8P13378 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
HOXD8P13378 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
HOXD8P13378 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
HOXD8P13378 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
HOXD8P13378 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
HOXD8P13378 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
HOXD8P13378 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
HOXD8P13378 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
HOXD8P13378 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
HOXD8P13378 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
HOXD8P13378 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
HOXD8P13378 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
HOXD8P13378 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
HOXD8P13378 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
HOXD8P13378 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
HOXD8P13378 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
HOXD8P13378 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
HOXD8P13378 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
HOXD8P13378 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
HOXD8P13378 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
HOXD8P13378 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
HOXD8P13378 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
HOXD8P13378 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
HOXD8P13378 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
HOXD8P13378 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
HOXD8P13378 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
HOXD8P13378 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
HOXD8P13378 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
HOXD8P13378 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
HOXD8P13378 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
HOXD8P13378 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
HOXD8P13378 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
HOXD8P13378 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
HOXD8P13378 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
HOXD8P13378 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
HOXD8P13378 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
HOXD8P13378 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
HOXD8P13378 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
HOXD8P13378 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
HOXD8P13378 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
HOXD8P13378 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
HOXD8P13378 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
HOXD8P13378 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
HOXD8P13378 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
HOXD8P13378 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
HOXD8P13378 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
HOXD8P13378 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.2 ms