Protein–RNA interactions for Protein: P13010

XRCC5, X-ray repair cross-complementing protein 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC5P13010 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
XRCC5P13010 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
XRCC5P13010 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
XRCC5P13010 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
XRCC5P13010 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
XRCC5P13010 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
XRCC5P13010 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
XRCC5P13010 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
XRCC5P13010 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
XRCC5P13010 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
XRCC5P13010 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
XRCC5P13010 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
XRCC5P13010 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
XRCC5P13010 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
XRCC5P13010 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
XRCC5P13010 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
XRCC5P13010 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
XRCC5P13010 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
XRCC5P13010 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
XRCC5P13010 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
XRCC5P13010 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
XRCC5P13010 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
XRCC5P13010 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
XRCC5P13010 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
XRCC5P13010 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
XRCC5P13010 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
XRCC5P13010 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
XRCC5P13010 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
XRCC5P13010 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
XRCC5P13010 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
XRCC5P13010 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.61■■■□□ 2.33
XRCC5P13010 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
XRCC5P13010 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
XRCC5P13010 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
XRCC5P13010 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
XRCC5P13010 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
XRCC5P13010 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
XRCC5P13010 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
XRCC5P13010 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
XRCC5P13010 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
XRCC5P13010 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
XRCC5P13010 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
XRCC5P13010 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
XRCC5P13010 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
XRCC5P13010 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.57■■■□□ 2.32
XRCC5P13010 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
XRCC5P13010 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
XRCC5P13010 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
XRCC5P13010 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
XRCC5P13010 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
XRCC5P13010 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
XRCC5P13010 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
XRCC5P13010 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
XRCC5P13010 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
XRCC5P13010 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
XRCC5P13010 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
XRCC5P13010 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
XRCC5P13010 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
XRCC5P13010 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
XRCC5P13010 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
XRCC5P13010 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
XRCC5P13010 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
XRCC5P13010 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
XRCC5P13010 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
XRCC5P13010 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
XRCC5P13010 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
XRCC5P13010 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
XRCC5P13010 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
XRCC5P13010 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
XRCC5P13010 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
XRCC5P13010 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
XRCC5P13010 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
XRCC5P13010 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
XRCC5P13010 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
XRCC5P13010 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
XRCC5P13010 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
XRCC5P13010 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
XRCC5P13010 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
XRCC5P13010 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
XRCC5P13010 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
XRCC5P13010 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
XRCC5P13010 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
XRCC5P13010 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
XRCC5P13010 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
XRCC5P13010 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
XRCC5P13010 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
XRCC5P13010 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
XRCC5P13010 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
XRCC5P13010 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
XRCC5P13010 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
XRCC5P13010 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
XRCC5P13010 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
XRCC5P13010 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
XRCC5P13010 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
XRCC5P13010 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
XRCC5P13010 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
XRCC5P13010 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
XRCC5P13010 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
XRCC5P13010 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC29.37■■■□□ 2.29
XRCC5P13010 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms