Protein–RNA interactions for Protein: P11215

ITGAM, Integrin alpha-M, humanhuman

Predictions only

Length 1,152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAMP11215 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ITGAMP11215 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
ITGAMP11215 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ITGAMP11215 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ITGAMP11215 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ITGAMP11215 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ITGAMP11215 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ITGAMP11215 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ITGAMP11215 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ITGAMP11215 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ITGAMP11215 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ITGAMP11215 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ITGAMP11215 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ITGAMP11215 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ITGAMP11215 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ITGAMP11215 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ITGAMP11215 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ITGAMP11215 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ITGAMP11215 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ITGAMP11215 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ITGAMP11215 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ITGAMP11215 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ITGAMP11215 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ITGAMP11215 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ITGAMP11215 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ITGAMP11215 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ITGAMP11215 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ITGAMP11215 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ITGAMP11215 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ITGAMP11215 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ITGAMP11215 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ITGAMP11215 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ITGAMP11215 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ITGAMP11215 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ITGAMP11215 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
ITGAMP11215 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ITGAMP11215 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ITGAMP11215 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ITGAMP11215 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ITGAMP11215 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ITGAMP11215 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ITGAMP11215 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ITGAMP11215 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ITGAMP11215 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ITGAMP11215 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ITGAMP11215 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ITGAMP11215 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ITGAMP11215 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ITGAMP11215 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ITGAMP11215 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ITGAMP11215 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ITGAMP11215 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ITGAMP11215 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ITGAMP11215 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ITGAMP11215 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ITGAMP11215 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ITGAMP11215 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ITGAMP11215 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ITGAMP11215 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ITGAMP11215 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ITGAMP11215 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ITGAMP11215 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ITGAMP11215 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ITGAMP11215 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ITGAMP11215 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ITGAMP11215 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ITGAMP11215 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ITGAMP11215 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ITGAMP11215 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ITGAMP11215 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ITGAMP11215 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ITGAMP11215 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ITGAMP11215 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ITGAMP11215 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ITGAMP11215 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ITGAMP11215 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ITGAMP11215 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ITGAMP11215 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ITGAMP11215 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ITGAMP11215 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ITGAMP11215 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ITGAMP11215 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ITGAMP11215 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
ITGAMP11215 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ITGAMP11215 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ITGAMP11215 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ITGAMP11215 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ITGAMP11215 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ITGAMP11215 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ITGAMP11215 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ITGAMP11215 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ITGAMP11215 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ITGAMP11215 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ITGAMP11215 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ITGAMP11215 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ITGAMP11215 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ITGAMP11215 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ITGAMP11215 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ITGAMP11215 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ITGAMP11215 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms