Protein–RNA interactions for Protein: P0C862

C1QTNF9, Complement C1q and tumor necrosis factor-related protein 9A, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QTNF9P0C862 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
C1QTNF9P0C862 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
C1QTNF9P0C862 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
C1QTNF9P0C862 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
C1QTNF9P0C862 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
C1QTNF9P0C862 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
C1QTNF9P0C862 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
C1QTNF9P0C862 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
C1QTNF9P0C862 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
C1QTNF9P0C862 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
C1QTNF9P0C862 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
C1QTNF9P0C862 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
C1QTNF9P0C862 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
C1QTNF9P0C862 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
C1QTNF9P0C862 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
C1QTNF9P0C862 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
C1QTNF9P0C862 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
C1QTNF9P0C862 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
C1QTNF9P0C862 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
C1QTNF9P0C862 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
C1QTNF9P0C862 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
C1QTNF9P0C862 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
C1QTNF9P0C862 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
C1QTNF9P0C862 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
C1QTNF9P0C862 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
C1QTNF9P0C862 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
C1QTNF9P0C862 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
C1QTNF9P0C862 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
C1QTNF9P0C862 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
C1QTNF9P0C862 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
C1QTNF9P0C862 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
C1QTNF9P0C862 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
C1QTNF9P0C862 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
C1QTNF9P0C862 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
C1QTNF9P0C862 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
C1QTNF9P0C862 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
C1QTNF9P0C862 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
C1QTNF9P0C862 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
C1QTNF9P0C862 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
C1QTNF9P0C862 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
C1QTNF9P0C862 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
C1QTNF9P0C862 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
C1QTNF9P0C862 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
C1QTNF9P0C862 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
C1QTNF9P0C862 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
C1QTNF9P0C862 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
C1QTNF9P0C862 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
C1QTNF9P0C862 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
C1QTNF9P0C862 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
C1QTNF9P0C862 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
C1QTNF9P0C862 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
C1QTNF9P0C862 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
C1QTNF9P0C862 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
C1QTNF9P0C862 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
C1QTNF9P0C862 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
C1QTNF9P0C862 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
C1QTNF9P0C862 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
C1QTNF9P0C862 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
C1QTNF9P0C862 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
C1QTNF9P0C862 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
C1QTNF9P0C862 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
C1QTNF9P0C862 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
C1QTNF9P0C862 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
C1QTNF9P0C862 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
C1QTNF9P0C862 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
C1QTNF9P0C862 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
C1QTNF9P0C862 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
C1QTNF9P0C862 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
C1QTNF9P0C862 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
C1QTNF9P0C862 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
C1QTNF9P0C862 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
C1QTNF9P0C862 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
C1QTNF9P0C862 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
C1QTNF9P0C862 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
C1QTNF9P0C862 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
C1QTNF9P0C862 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
C1QTNF9P0C862 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
C1QTNF9P0C862 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
C1QTNF9P0C862 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
C1QTNF9P0C862 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
C1QTNF9P0C862 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
C1QTNF9P0C862 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
C1QTNF9P0C862 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
C1QTNF9P0C862 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
C1QTNF9P0C862 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
C1QTNF9P0C862 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
C1QTNF9P0C862 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
C1QTNF9P0C862 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
C1QTNF9P0C862 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
C1QTNF9P0C862 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
C1QTNF9P0C862 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
C1QTNF9P0C862 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
C1QTNF9P0C862 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
C1QTNF9P0C862 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
C1QTNF9P0C862 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
C1QTNF9P0C862 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
C1QTNF9P0C862 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
C1QTNF9P0C862 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
C1QTNF9P0C862 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
C1QTNF9P0C862 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms