Protein–RNA interactions for Protein: P0C7I6

CCDC159, Coiled-coil domain-containing protein 159, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC159P0C7I6 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC159P0C7I6 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC159P0C7I6 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC159P0C7I6 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC159P0C7I6 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC159P0C7I6 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC159P0C7I6 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC159P0C7I6 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC159P0C7I6 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC159P0C7I6 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC159P0C7I6 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC159P0C7I6 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC159P0C7I6 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC159P0C7I6 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC159P0C7I6 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC159P0C7I6 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC159P0C7I6 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC159P0C7I6 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC159P0C7I6 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC159P0C7I6 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC159P0C7I6 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC159P0C7I6 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC159P0C7I6 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCDC159P0C7I6 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCDC159P0C7I6 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC159P0C7I6 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC159P0C7I6 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC159P0C7I6 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC159P0C7I6 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC159P0C7I6 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC159P0C7I6 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC159P0C7I6 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC159P0C7I6 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC159P0C7I6 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC159P0C7I6 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC159P0C7I6 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC159P0C7I6 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC159P0C7I6 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC159P0C7I6 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC159P0C7I6 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC159P0C7I6 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC159P0C7I6 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC159P0C7I6 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC159P0C7I6 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC159P0C7I6 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC159P0C7I6 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC159P0C7I6 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC159P0C7I6 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC159P0C7I6 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC159P0C7I6 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC159P0C7I6 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC159P0C7I6 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC159P0C7I6 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC159P0C7I6 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC159P0C7I6 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC159P0C7I6 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC159P0C7I6 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC159P0C7I6 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC159P0C7I6 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC159P0C7I6 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC159P0C7I6 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC159P0C7I6 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC159P0C7I6 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC159P0C7I6 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC159P0C7I6 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC159P0C7I6 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC159P0C7I6 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC159P0C7I6 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC159P0C7I6 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC159P0C7I6 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC159P0C7I6 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC159P0C7I6 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC159P0C7I6 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC159P0C7I6 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC159P0C7I6 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC159P0C7I6 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC159P0C7I6 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC159P0C7I6 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC159P0C7I6 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC159P0C7I6 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC159P0C7I6 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC159P0C7I6 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC159P0C7I6 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC159P0C7I6 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC159P0C7I6 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC159P0C7I6 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC159P0C7I6 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC159P0C7I6 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC159P0C7I6 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC159P0C7I6 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC159P0C7I6 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC159P0C7I6 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC159P0C7I6 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC159P0C7I6 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC159P0C7I6 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC159P0C7I6 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC159P0C7I6 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC159P0C7I6 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC159P0C7I6 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC159P0C7I6 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms