Protein–RNA interactions for Protein: P08254

MMP3, Stromelysin-1, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP3P08254 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
MMP3P08254 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
MMP3P08254 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
MMP3P08254 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
MMP3P08254 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
MMP3P08254 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
MMP3P08254 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
MMP3P08254 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.22
MMP3P08254 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
MMP3P08254 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
MMP3P08254 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
MMP3P08254 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
MMP3P08254 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
MMP3P08254 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
MMP3P08254 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
MMP3P08254 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
MMP3P08254 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
MMP3P08254 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
MMP3P08254 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
MMP3P08254 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
MMP3P08254 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
MMP3P08254 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
MMP3P08254 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
MMP3P08254 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
MMP3P08254 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
MMP3P08254 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
MMP3P08254 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
MMP3P08254 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
MMP3P08254 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
MMP3P08254 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
MMP3P08254 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
MMP3P08254 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
MMP3P08254 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
MMP3P08254 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
MMP3P08254 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
MMP3P08254 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
MMP3P08254 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
MMP3P08254 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
MMP3P08254 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
MMP3P08254 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
MMP3P08254 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
MMP3P08254 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
MMP3P08254 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
MMP3P08254 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
MMP3P08254 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
MMP3P08254 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
MMP3P08254 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
MMP3P08254 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
MMP3P08254 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
MMP3P08254 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
MMP3P08254 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
MMP3P08254 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
MMP3P08254 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
MMP3P08254 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
MMP3P08254 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
MMP3P08254 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
MMP3P08254 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
MMP3P08254 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
MMP3P08254 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
MMP3P08254 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
MMP3P08254 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
MMP3P08254 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
MMP3P08254 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
MMP3P08254 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
MMP3P08254 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
MMP3P08254 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
MMP3P08254 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
MMP3P08254 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
MMP3P08254 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
MMP3P08254 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
MMP3P08254 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
MMP3P08254 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
MMP3P08254 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
MMP3P08254 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
MMP3P08254 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
MMP3P08254 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
MMP3P08254 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
MMP3P08254 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
MMP3P08254 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
MMP3P08254 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
MMP3P08254 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
MMP3P08254 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
MMP3P08254 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
MMP3P08254 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
MMP3P08254 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
MMP3P08254 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
MMP3P08254 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
MMP3P08254 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
MMP3P08254 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
MMP3P08254 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
MMP3P08254 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
MMP3P08254 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
MMP3P08254 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
MMP3P08254 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
MMP3P08254 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
MMP3P08254 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
MMP3P08254 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
MMP3P08254 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
MMP3P08254 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
MMP3P08254 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.2 ms