Protein–RNA interactions for Protein: P01817

IGHV2-5, Immunoglobulin heavy variable 2-5, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV2-5P01817 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
IGHV2-5P01817 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
IGHV2-5P01817 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
IGHV2-5P01817 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
IGHV2-5P01817 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
IGHV2-5P01817 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
IGHV2-5P01817 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
IGHV2-5P01817 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
IGHV2-5P01817 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
IGHV2-5P01817 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
IGHV2-5P01817 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
IGHV2-5P01817 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
IGHV2-5P01817 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
IGHV2-5P01817 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
IGHV2-5P01817 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
IGHV2-5P01817 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
IGHV2-5P01817 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
IGHV2-5P01817 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
IGHV2-5P01817 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
IGHV2-5P01817 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
IGHV2-5P01817 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
IGHV2-5P01817 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
IGHV2-5P01817 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
IGHV2-5P01817 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
IGHV2-5P01817 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
IGHV2-5P01817 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
IGHV2-5P01817 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
IGHV2-5P01817 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IGHV2-5P01817 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IGHV2-5P01817 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IGHV2-5P01817 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
IGHV2-5P01817 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IGHV2-5P01817 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IGHV2-5P01817 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
IGHV2-5P01817 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IGHV2-5P01817 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IGHV2-5P01817 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
IGHV2-5P01817 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
IGHV2-5P01817 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
IGHV2-5P01817 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
IGHV2-5P01817 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
IGHV2-5P01817 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
IGHV2-5P01817 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
IGHV2-5P01817 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
IGHV2-5P01817 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
IGHV2-5P01817 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IGHV2-5P01817 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IGHV2-5P01817 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
IGHV2-5P01817 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IGHV2-5P01817 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IGHV2-5P01817 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IGHV2-5P01817 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
IGHV2-5P01817 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
IGHV2-5P01817 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
IGHV2-5P01817 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
IGHV2-5P01817 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IGHV2-5P01817 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
IGHV2-5P01817 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
IGHV2-5P01817 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
IGHV2-5P01817 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
IGHV2-5P01817 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
IGHV2-5P01817 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
IGHV2-5P01817 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
IGHV2-5P01817 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
IGHV2-5P01817 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
IGHV2-5P01817 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IGHV2-5P01817 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IGHV2-5P01817 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IGHV2-5P01817 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
IGHV2-5P01817 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
IGHV2-5P01817 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IGHV2-5P01817 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
IGHV2-5P01817 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IGHV2-5P01817 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IGHV2-5P01817 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IGHV2-5P01817 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
IGHV2-5P01817 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
IGHV2-5P01817 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IGHV2-5P01817 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IGHV2-5P01817 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
IGHV2-5P01817 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
IGHV2-5P01817 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
IGHV2-5P01817 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
IGHV2-5P01817 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
IGHV2-5P01817 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
IGHV2-5P01817 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
IGHV2-5P01817 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
IGHV2-5P01817 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
IGHV2-5P01817 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
IGHV2-5P01817 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
IGHV2-5P01817 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IGHV2-5P01817 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IGHV2-5P01817 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IGHV2-5P01817 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IGHV2-5P01817 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
IGHV2-5P01817 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
IGHV2-5P01817 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IGHV2-5P01817 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IGHV2-5P01817 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IGHV2-5P01817 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms