Protein–RNA interactions for Protein: O95996

APC2, Adenomatous polyposis coli protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 2,303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APC2O95996 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
APC2O95996 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
APC2O95996 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
APC2O95996 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
APC2O95996 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
APC2O95996 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
APC2O95996 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
APC2O95996 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
APC2O95996 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
APC2O95996 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
APC2O95996 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
APC2O95996 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
APC2O95996 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
APC2O95996 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
APC2O95996 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
APC2O95996 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
APC2O95996 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
APC2O95996 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
APC2O95996 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
APC2O95996 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
APC2O95996 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
APC2O95996 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
APC2O95996 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
APC2O95996 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
APC2O95996 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
APC2O95996 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
APC2O95996 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
APC2O95996 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
APC2O95996 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
APC2O95996 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
APC2O95996 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
APC2O95996 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
APC2O95996 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
APC2O95996 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
APC2O95996 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
APC2O95996 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
APC2O95996 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
APC2O95996 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
APC2O95996 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
APC2O95996 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
APC2O95996 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
APC2O95996 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
APC2O95996 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
APC2O95996 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
APC2O95996 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
APC2O95996 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
APC2O95996 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
APC2O95996 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
APC2O95996 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
APC2O95996 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
APC2O95996 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
APC2O95996 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
APC2O95996 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
APC2O95996 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
APC2O95996 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
APC2O95996 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
APC2O95996 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
APC2O95996 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
APC2O95996 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
APC2O95996 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
APC2O95996 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
APC2O95996 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
APC2O95996 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
APC2O95996 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
APC2O95996 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
APC2O95996 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
APC2O95996 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
APC2O95996 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
APC2O95996 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
APC2O95996 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
APC2O95996 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
APC2O95996 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
APC2O95996 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
APC2O95996 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
APC2O95996 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
APC2O95996 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
APC2O95996 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
APC2O95996 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
APC2O95996 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
APC2O95996 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
APC2O95996 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
APC2O95996 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
APC2O95996 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
APC2O95996 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
APC2O95996 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
APC2O95996 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
APC2O95996 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
APC2O95996 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
APC2O95996 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
APC2O95996 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
APC2O95996 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
APC2O95996 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
APC2O95996 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
APC2O95996 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
APC2O95996 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
APC2O95996 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
APC2O95996 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
APC2O95996 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
APC2O95996 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
APC2O95996 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms