Protein–RNA interactions for Protein: O95455

TGDS, dTDP-D-glucose 4,6-dehydratase, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGDSO95455 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TGDSO95455 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
TGDSO95455 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TGDSO95455 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TGDSO95455 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TGDSO95455 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TGDSO95455 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TGDSO95455 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TGDSO95455 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TGDSO95455 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TGDSO95455 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TGDSO95455 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TGDSO95455 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TGDSO95455 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TGDSO95455 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TGDSO95455 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TGDSO95455 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TGDSO95455 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TGDSO95455 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TGDSO95455 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TGDSO95455 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TGDSO95455 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TGDSO95455 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TGDSO95455 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TGDSO95455 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TGDSO95455 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TGDSO95455 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TGDSO95455 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TGDSO95455 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TGDSO95455 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TGDSO95455 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TGDSO95455 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TGDSO95455 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TGDSO95455 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TGDSO95455 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TGDSO95455 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TGDSO95455 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TGDSO95455 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TGDSO95455 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TGDSO95455 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TGDSO95455 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TGDSO95455 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TGDSO95455 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TGDSO95455 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TGDSO95455 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TGDSO95455 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TGDSO95455 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TGDSO95455 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
TGDSO95455 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TGDSO95455 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TGDSO95455 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TGDSO95455 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TGDSO95455 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TGDSO95455 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TGDSO95455 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TGDSO95455 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TGDSO95455 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TGDSO95455 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TGDSO95455 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TGDSO95455 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TGDSO95455 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TGDSO95455 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
TGDSO95455 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TGDSO95455 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TGDSO95455 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TGDSO95455 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TGDSO95455 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TGDSO95455 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TGDSO95455 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TGDSO95455 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TGDSO95455 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TGDSO95455 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TGDSO95455 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TGDSO95455 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TGDSO95455 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TGDSO95455 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TGDSO95455 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TGDSO95455 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TGDSO95455 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TGDSO95455 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TGDSO95455 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TGDSO95455 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TGDSO95455 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TGDSO95455 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
TGDSO95455 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TGDSO95455 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TGDSO95455 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TGDSO95455 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TGDSO95455 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TGDSO95455 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TGDSO95455 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TGDSO95455 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TGDSO95455 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TGDSO95455 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TGDSO95455 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TGDSO95455 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TGDSO95455 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TGDSO95455 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TGDSO95455 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TGDSO95455 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms