Protein–RNA interactions for Protein: O95409

ZIC2, Zinc finger protein ZIC 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC2O95409 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZIC2O95409 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
ZIC2O95409 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZIC2O95409 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZIC2O95409 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZIC2O95409 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZIC2O95409 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZIC2O95409 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZIC2O95409 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZIC2O95409 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZIC2O95409 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ZIC2O95409 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZIC2O95409 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZIC2O95409 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZIC2O95409 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZIC2O95409 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZIC2O95409 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZIC2O95409 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZIC2O95409 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZIC2O95409 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZIC2O95409 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZIC2O95409 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZIC2O95409 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZIC2O95409 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZIC2O95409 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ZIC2O95409 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
ZIC2O95409 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZIC2O95409 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZIC2O95409 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZIC2O95409 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZIC2O95409 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZIC2O95409 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZIC2O95409 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZIC2O95409 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZIC2O95409 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZIC2O95409 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZIC2O95409 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZIC2O95409 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZIC2O95409 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ZIC2O95409 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZIC2O95409 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZIC2O95409 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZIC2O95409 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ZIC2O95409 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZIC2O95409 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZIC2O95409 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZIC2O95409 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZIC2O95409 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZIC2O95409 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZIC2O95409 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZIC2O95409 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ZIC2O95409 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZIC2O95409 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZIC2O95409 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZIC2O95409 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZIC2O95409 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZIC2O95409 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZIC2O95409 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZIC2O95409 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZIC2O95409 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZIC2O95409 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZIC2O95409 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZIC2O95409 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZIC2O95409 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZIC2O95409 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZIC2O95409 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZIC2O95409 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZIC2O95409 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZIC2O95409 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZIC2O95409 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZIC2O95409 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZIC2O95409 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZIC2O95409 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZIC2O95409 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZIC2O95409 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZIC2O95409 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZIC2O95409 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZIC2O95409 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZIC2O95409 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZIC2O95409 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZIC2O95409 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZIC2O95409 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ZIC2O95409 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZIC2O95409 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZIC2O95409 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZIC2O95409 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZIC2O95409 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZIC2O95409 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZIC2O95409 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZIC2O95409 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZIC2O95409 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZIC2O95409 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ZIC2O95409 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZIC2O95409 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZIC2O95409 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZIC2O95409 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZIC2O95409 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZIC2O95409 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ZIC2O95409 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ZIC2O95409 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 400.3 ms