Protein–RNA interactions for Protein: O75379

VAMP4, Vesicle-associated membrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP4O75379 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
VAMP4O75379 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
VAMP4O75379 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
VAMP4O75379 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
VAMP4O75379 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
VAMP4O75379 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
VAMP4O75379 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
VAMP4O75379 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
VAMP4O75379 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
VAMP4O75379 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
VAMP4O75379 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
VAMP4O75379 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
VAMP4O75379 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
VAMP4O75379 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
VAMP4O75379 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC33.13■■■□□ 2.89
VAMP4O75379 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
VAMP4O75379 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
VAMP4O75379 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
VAMP4O75379 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
VAMP4O75379 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
VAMP4O75379 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
VAMP4O75379 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
VAMP4O75379 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
VAMP4O75379 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
VAMP4O75379 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
VAMP4O75379 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
VAMP4O75379 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
VAMP4O75379 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
VAMP4O75379 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
VAMP4O75379 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
VAMP4O75379 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
VAMP4O75379 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC33.07■■■□□ 2.88
VAMP4O75379 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
VAMP4O75379 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
VAMP4O75379 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC33.07■■■□□ 2.88
VAMP4O75379 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
VAMP4O75379 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
VAMP4O75379 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC33.06■■■□□ 2.88
VAMP4O75379 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
VAMP4O75379 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
VAMP4O75379 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC33.04■■■□□ 2.88
VAMP4O75379 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
VAMP4O75379 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
VAMP4O75379 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
VAMP4O75379 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
VAMP4O75379 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
VAMP4O75379 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
VAMP4O75379 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
VAMP4O75379 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.88
VAMP4O75379 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.87
VAMP4O75379 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC33.01■■■□□ 2.87
VAMP4O75379 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.87
VAMP4O75379 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
VAMP4O75379 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
VAMP4O75379 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
VAMP4O75379 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
VAMP4O75379 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
VAMP4O75379 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
VAMP4O75379 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
VAMP4O75379 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
VAMP4O75379 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
VAMP4O75379 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
VAMP4O75379 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
VAMP4O75379 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
VAMP4O75379 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
VAMP4O75379 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
VAMP4O75379 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
VAMP4O75379 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
VAMP4O75379 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
VAMP4O75379 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC32.96■■■□□ 2.87
VAMP4O75379 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
VAMP4O75379 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
VAMP4O75379 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
VAMP4O75379 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.87
VAMP4O75379 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
VAMP4O75379 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
VAMP4O75379 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
VAMP4O75379 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
VAMP4O75379 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
VAMP4O75379 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
VAMP4O75379 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
VAMP4O75379 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
VAMP4O75379 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
VAMP4O75379 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
VAMP4O75379 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
VAMP4O75379 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
VAMP4O75379 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
VAMP4O75379 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC32.91■■■□□ 2.86
VAMP4O75379 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
VAMP4O75379 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
VAMP4O75379 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
VAMP4O75379 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
VAMP4O75379 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
VAMP4O75379 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
VAMP4O75379 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC32.9■■■□□ 2.86
VAMP4O75379 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC32.9■■■□□ 2.86
VAMP4O75379 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
VAMP4O75379 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
VAMP4O75379 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
VAMP4O75379 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms