Protein–RNA interactions for Protein: O75113

N4BP1, NEDD4-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 896 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
N4BP1O75113 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
N4BP1O75113 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
N4BP1O75113 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
N4BP1O75113 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
N4BP1O75113 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
N4BP1O75113 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
N4BP1O75113 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
N4BP1O75113 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
N4BP1O75113 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
N4BP1O75113 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
N4BP1O75113 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
N4BP1O75113 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
N4BP1O75113 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
N4BP1O75113 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
N4BP1O75113 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
N4BP1O75113 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
N4BP1O75113 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
N4BP1O75113 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
N4BP1O75113 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
N4BP1O75113 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
N4BP1O75113 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
N4BP1O75113 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
N4BP1O75113 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
N4BP1O75113 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
N4BP1O75113 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
N4BP1O75113 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
N4BP1O75113 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
N4BP1O75113 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
N4BP1O75113 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
N4BP1O75113 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
N4BP1O75113 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
N4BP1O75113 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
N4BP1O75113 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
N4BP1O75113 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
N4BP1O75113 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
N4BP1O75113 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
N4BP1O75113 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
N4BP1O75113 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.08■■■□□ 2.09
N4BP1O75113 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
N4BP1O75113 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
N4BP1O75113 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
N4BP1O75113 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
N4BP1O75113 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
N4BP1O75113 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
N4BP1O75113 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
N4BP1O75113 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
N4BP1O75113 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
N4BP1O75113 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
N4BP1O75113 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
N4BP1O75113 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
N4BP1O75113 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
N4BP1O75113 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
N4BP1O75113 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
N4BP1O75113 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
N4BP1O75113 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
N4BP1O75113 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
N4BP1O75113 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
N4BP1O75113 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
N4BP1O75113 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
N4BP1O75113 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
N4BP1O75113 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
N4BP1O75113 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
N4BP1O75113 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
N4BP1O75113 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
N4BP1O75113 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
N4BP1O75113 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
N4BP1O75113 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
N4BP1O75113 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
N4BP1O75113 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
N4BP1O75113 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
N4BP1O75113 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28■■■□□ 2.07
N4BP1O75113 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28■■■□□ 2.07
N4BP1O75113 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28■■■□□ 2.07
N4BP1O75113 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
N4BP1O75113 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.99■■■□□ 2.07
N4BP1O75113 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
N4BP1O75113 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
N4BP1O75113 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
N4BP1O75113 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
N4BP1O75113 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
N4BP1O75113 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
N4BP1O75113 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
N4BP1O75113 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
N4BP1O75113 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
N4BP1O75113 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
N4BP1O75113 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
N4BP1O75113 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
N4BP1O75113 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
N4BP1O75113 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
N4BP1O75113 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
N4BP1O75113 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
N4BP1O75113 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
N4BP1O75113 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
N4BP1O75113 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
N4BP1O75113 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
N4BP1O75113 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
N4BP1O75113 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
N4BP1O75113 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
N4BP1O75113 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
N4BP1O75113 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms