Protein–RNA interactions for Protein: O60662

KLHL41, Kelch-like protein 41, humanhuman

Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL41O60662 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KLHL41O60662 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KLHL41O60662 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KLHL41O60662 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KLHL41O60662 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KLHL41O60662 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KLHL41O60662 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KLHL41O60662 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KLHL41O60662 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KLHL41O60662 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
KLHL41O60662 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KLHL41O60662 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KLHL41O60662 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
KLHL41O60662 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
KLHL41O60662 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
KLHL41O60662 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KLHL41O60662 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KLHL41O60662 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KLHL41O60662 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KLHL41O60662 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KLHL41O60662 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KLHL41O60662 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KLHL41O60662 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KLHL41O60662 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KLHL41O60662 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KLHL41O60662 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KLHL41O60662 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KLHL41O60662 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KLHL41O60662 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KLHL41O60662 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KLHL41O60662 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KLHL41O60662 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KLHL41O60662 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KLHL41O60662 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KLHL41O60662 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KLHL41O60662 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KLHL41O60662 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KLHL41O60662 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KLHL41O60662 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
KLHL41O60662 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
KLHL41O60662 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KLHL41O60662 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KLHL41O60662 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KLHL41O60662 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KLHL41O60662 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KLHL41O60662 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KLHL41O60662 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KLHL41O60662 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KLHL41O60662 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KLHL41O60662 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KLHL41O60662 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KLHL41O60662 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KLHL41O60662 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KLHL41O60662 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KLHL41O60662 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KLHL41O60662 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KLHL41O60662 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KLHL41O60662 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KLHL41O60662 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KLHL41O60662 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KLHL41O60662 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KLHL41O60662 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KLHL41O60662 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
KLHL41O60662 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KLHL41O60662 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
KLHL41O60662 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
KLHL41O60662 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KLHL41O60662 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KLHL41O60662 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KLHL41O60662 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KLHL41O60662 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KLHL41O60662 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KLHL41O60662 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KLHL41O60662 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KLHL41O60662 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KLHL41O60662 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KLHL41O60662 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KLHL41O60662 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KLHL41O60662 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KLHL41O60662 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KLHL41O60662 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KLHL41O60662 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KLHL41O60662 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KLHL41O60662 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KLHL41O60662 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KLHL41O60662 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KLHL41O60662 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KLHL41O60662 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KLHL41O60662 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KLHL41O60662 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KLHL41O60662 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KLHL41O60662 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KLHL41O60662 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KLHL41O60662 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KLHL41O60662 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KLHL41O60662 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KLHL41O60662 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KLHL41O60662 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
KLHL41O60662 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
KLHL41O60662 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 127.8 ms