Protein–RNA interactions for Protein: O60449

LY75, Lymphocyte antigen 75, humanhuman

Predictions only

Length 1,722 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LY75O60449 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
LY75O60449 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
LY75O60449 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC33.56■■■□□ 2.96
LY75O60449 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
LY75O60449 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
LY75O60449 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
LY75O60449 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
LY75O60449 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.55■■■□□ 2.96
LY75O60449 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
LY75O60449 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC33.55■■■□□ 2.96
LY75O60449 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC33.54■■■□□ 2.96
LY75O60449 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
LY75O60449 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
LY75O60449 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
LY75O60449 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
LY75O60449 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
LY75O60449 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
LY75O60449 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC33.51■■■□□ 2.96
LY75O60449 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
LY75O60449 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
LY75O60449 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
LY75O60449 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
LY75O60449 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.48■■■□□ 2.95
LY75O60449 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
LY75O60449 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
LY75O60449 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC33.48■■■□□ 2.95
LY75O60449 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
LY75O60449 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
LY75O60449 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
LY75O60449 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
LY75O60449 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
LY75O60449 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
LY75O60449 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
LY75O60449 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
LY75O60449 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
LY75O60449 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
LY75O60449 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
LY75O60449 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
LY75O60449 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC33.43■■■□□ 2.94
LY75O60449 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
LY75O60449 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
LY75O60449 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
LY75O60449 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
LY75O60449 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
LY75O60449 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
LY75O60449 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
LY75O60449 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
LY75O60449 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
LY75O60449 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
LY75O60449 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
LY75O60449 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
LY75O60449 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
LY75O60449 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC33.37■■■□□ 2.93
LY75O60449 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
LY75O60449 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC33.36■■■□□ 2.93
LY75O60449 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
LY75O60449 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
LY75O60449 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
LY75O60449 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
LY75O60449 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
LY75O60449 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
LY75O60449 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.93
LY75O60449 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
LY75O60449 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
LY75O60449 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
LY75O60449 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
LY75O60449 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
LY75O60449 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
LY75O60449 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
LY75O60449 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
LY75O60449 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
LY75O60449 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
LY75O60449 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
LY75O60449 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
LY75O60449 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
LY75O60449 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
LY75O60449 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.28■■■□□ 2.92
LY75O60449 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
LY75O60449 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
LY75O60449 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
LY75O60449 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC33.26■■■□□ 2.92
LY75O60449 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC33.26■■■□□ 2.91
LY75O60449 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC33.26■■■□□ 2.91
LY75O60449 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
LY75O60449 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
LY75O60449 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
LY75O60449 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
LY75O60449 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
LY75O60449 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
LY75O60449 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
LY75O60449 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
LY75O60449 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
LY75O60449 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
LY75O60449 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
LY75O60449 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
LY75O60449 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
LY75O60449 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
LY75O60449 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC33.21■■■□□ 2.91
LY75O60449 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
LY75O60449 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.7 ms