Protein–RNA interactions for Protein: O60240

PLIN1, Perilipin-1, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLIN1O60240 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
PLIN1O60240 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
PLIN1O60240 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
PLIN1O60240 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
PLIN1O60240 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
PLIN1O60240 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
PLIN1O60240 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
PLIN1O60240 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
PLIN1O60240 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
PLIN1O60240 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
PLIN1O60240 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
PLIN1O60240 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
PLIN1O60240 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
PLIN1O60240 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
PLIN1O60240 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
PLIN1O60240 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
PLIN1O60240 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
PLIN1O60240 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
PLIN1O60240 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
PLIN1O60240 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC33.19■■■□□ 2.9
PLIN1O60240 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
PLIN1O60240 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
PLIN1O60240 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
PLIN1O60240 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
PLIN1O60240 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
PLIN1O60240 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
PLIN1O60240 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
PLIN1O60240 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
PLIN1O60240 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
PLIN1O60240 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
PLIN1O60240 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
PLIN1O60240 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC33.14■■■□□ 2.9
PLIN1O60240 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
PLIN1O60240 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
PLIN1O60240 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
PLIN1O60240 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.13■■■□□ 2.89
PLIN1O60240 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
PLIN1O60240 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
PLIN1O60240 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
PLIN1O60240 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
PLIN1O60240 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
PLIN1O60240 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
PLIN1O60240 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
PLIN1O60240 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC33.11■■■□□ 2.89
PLIN1O60240 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
PLIN1O60240 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
PLIN1O60240 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
PLIN1O60240 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC33.09■■■□□ 2.89
PLIN1O60240 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC33.09■■■□□ 2.89
PLIN1O60240 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
PLIN1O60240 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
PLIN1O60240 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
PLIN1O60240 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
PLIN1O60240 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC33.06■■■□□ 2.88
PLIN1O60240 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
PLIN1O60240 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
PLIN1O60240 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
PLIN1O60240 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
PLIN1O60240 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC33.04■■■□□ 2.88
PLIN1O60240 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
PLIN1O60240 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC33.04■■■□□ 2.88
PLIN1O60240 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
PLIN1O60240 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
PLIN1O60240 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
PLIN1O60240 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
PLIN1O60240 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC33.04■■■□□ 2.88
PLIN1O60240 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC33.04■■■□□ 2.88
PLIN1O60240 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
PLIN1O60240 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
PLIN1O60240 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
PLIN1O60240 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC33.03■■■□□ 2.88
PLIN1O60240 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
PLIN1O60240 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
PLIN1O60240 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
PLIN1O60240 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
PLIN1O60240 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
PLIN1O60240 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
PLIN1O60240 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
PLIN1O60240 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
PLIN1O60240 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
PLIN1O60240 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
PLIN1O60240 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
PLIN1O60240 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
PLIN1O60240 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
PLIN1O60240 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
PLIN1O60240 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
PLIN1O60240 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
PLIN1O60240 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
PLIN1O60240 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
PLIN1O60240 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
PLIN1O60240 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
PLIN1O60240 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
PLIN1O60240 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
PLIN1O60240 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC32.96■■■□□ 2.87
PLIN1O60240 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
PLIN1O60240 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
PLIN1O60240 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC32.95■■■□□ 2.87
PLIN1O60240 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
PLIN1O60240 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
PLIN1O60240 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms