Protein–RNA interactions for Protein: O60229

KALRN, Kalirin, humanhuman

Predictions only

Length 2,985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KALRNO60229 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KALRNO60229 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
KALRNO60229 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KALRNO60229 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KALRNO60229 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
KALRNO60229 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KALRNO60229 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KALRNO60229 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KALRNO60229 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KALRNO60229 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KALRNO60229 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KALRNO60229 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KALRNO60229 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
KALRNO60229 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KALRNO60229 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KALRNO60229 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KALRNO60229 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KALRNO60229 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KALRNO60229 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KALRNO60229 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KALRNO60229 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KALRNO60229 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KALRNO60229 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KALRNO60229 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KALRNO60229 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KALRNO60229 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
KALRNO60229 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KALRNO60229 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KALRNO60229 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KALRNO60229 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KALRNO60229 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KALRNO60229 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KALRNO60229 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KALRNO60229 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KALRNO60229 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
KALRNO60229 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KALRNO60229 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KALRNO60229 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
KALRNO60229 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KALRNO60229 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KALRNO60229 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KALRNO60229 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KALRNO60229 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KALRNO60229 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KALRNO60229 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KALRNO60229 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KALRNO60229 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KALRNO60229 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KALRNO60229 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KALRNO60229 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KALRNO60229 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KALRNO60229 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KALRNO60229 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
KALRNO60229 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KALRNO60229 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KALRNO60229 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KALRNO60229 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KALRNO60229 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KALRNO60229 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KALRNO60229 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KALRNO60229 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KALRNO60229 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KALRNO60229 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KALRNO60229 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KALRNO60229 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
KALRNO60229 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KALRNO60229 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KALRNO60229 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KALRNO60229 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KALRNO60229 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KALRNO60229 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KALRNO60229 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KALRNO60229 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KALRNO60229 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KALRNO60229 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KALRNO60229 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KALRNO60229 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KALRNO60229 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KALRNO60229 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KALRNO60229 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KALRNO60229 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KALRNO60229 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KALRNO60229 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
KALRNO60229 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
KALRNO60229 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
KALRNO60229 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
KALRNO60229 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
KALRNO60229 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KALRNO60229 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KALRNO60229 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KALRNO60229 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KALRNO60229 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KALRNO60229 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KALRNO60229 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KALRNO60229 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
KALRNO60229 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KALRNO60229 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KALRNO60229 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KALRNO60229 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KALRNO60229 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.4 ms