Protein–RNA interactions for Protein: O43896

KIF1C, Kinesin-like protein KIF1C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF1CO43896 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KIF1CO43896 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
KIF1CO43896 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
KIF1CO43896 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KIF1CO43896 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KIF1CO43896 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KIF1CO43896 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KIF1CO43896 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KIF1CO43896 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
KIF1CO43896 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KIF1CO43896 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KIF1CO43896 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KIF1CO43896 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KIF1CO43896 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
KIF1CO43896 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KIF1CO43896 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KIF1CO43896 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KIF1CO43896 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KIF1CO43896 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KIF1CO43896 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
KIF1CO43896 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KIF1CO43896 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KIF1CO43896 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KIF1CO43896 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KIF1CO43896 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KIF1CO43896 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KIF1CO43896 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KIF1CO43896 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KIF1CO43896 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KIF1CO43896 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KIF1CO43896 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KIF1CO43896 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KIF1CO43896 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KIF1CO43896 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KIF1CO43896 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KIF1CO43896 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KIF1CO43896 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
KIF1CO43896 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KIF1CO43896 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KIF1CO43896 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KIF1CO43896 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KIF1CO43896 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KIF1CO43896 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KIF1CO43896 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KIF1CO43896 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KIF1CO43896 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KIF1CO43896 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KIF1CO43896 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KIF1CO43896 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KIF1CO43896 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KIF1CO43896 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KIF1CO43896 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KIF1CO43896 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KIF1CO43896 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KIF1CO43896 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KIF1CO43896 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KIF1CO43896 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KIF1CO43896 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KIF1CO43896 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
KIF1CO43896 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KIF1CO43896 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KIF1CO43896 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KIF1CO43896 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KIF1CO43896 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KIF1CO43896 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KIF1CO43896 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KIF1CO43896 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KIF1CO43896 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KIF1CO43896 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KIF1CO43896 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KIF1CO43896 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KIF1CO43896 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KIF1CO43896 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KIF1CO43896 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KIF1CO43896 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KIF1CO43896 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KIF1CO43896 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KIF1CO43896 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KIF1CO43896 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KIF1CO43896 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KIF1CO43896 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KIF1CO43896 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KIF1CO43896 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KIF1CO43896 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KIF1CO43896 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KIF1CO43896 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KIF1CO43896 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KIF1CO43896 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KIF1CO43896 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
KIF1CO43896 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KIF1CO43896 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KIF1CO43896 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KIF1CO43896 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KIF1CO43896 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KIF1CO43896 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KIF1CO43896 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KIF1CO43896 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KIF1CO43896 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KIF1CO43896 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KIF1CO43896 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms