Protein–RNA interactions for Protein: O43868

SLC28A2, Sodium/nucleoside cotransporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC28A2O43868 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC28A2O43868 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC28A2O43868 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC28A2O43868 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC28A2O43868 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC28A2O43868 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC28A2O43868 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC28A2O43868 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC28A2O43868 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC28A2O43868 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC28A2O43868 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC28A2O43868 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC28A2O43868 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC28A2O43868 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SLC28A2O43868 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SLC28A2O43868 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC28A2O43868 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC28A2O43868 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC28A2O43868 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC28A2O43868 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC28A2O43868 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC28A2O43868 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC28A2O43868 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC28A2O43868 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC28A2O43868 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC28A2O43868 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC28A2O43868 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC28A2O43868 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC28A2O43868 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC28A2O43868 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC28A2O43868 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC28A2O43868 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC28A2O43868 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC28A2O43868 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC28A2O43868 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC28A2O43868 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC28A2O43868 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC28A2O43868 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC28A2O43868 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC28A2O43868 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC28A2O43868 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC28A2O43868 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC28A2O43868 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC28A2O43868 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC28A2O43868 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC28A2O43868 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC28A2O43868 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC28A2O43868 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC28A2O43868 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC28A2O43868 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC28A2O43868 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC28A2O43868 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC28A2O43868 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC28A2O43868 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC28A2O43868 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC28A2O43868 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC28A2O43868 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC28A2O43868 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC28A2O43868 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC28A2O43868 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC28A2O43868 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC28A2O43868 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC28A2O43868 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC28A2O43868 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC28A2O43868 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC28A2O43868 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC28A2O43868 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC28A2O43868 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC28A2O43868 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC28A2O43868 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC28A2O43868 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC28A2O43868 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC28A2O43868 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC28A2O43868 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC28A2O43868 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC28A2O43868 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC28A2O43868 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC28A2O43868 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC28A2O43868 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC28A2O43868 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC28A2O43868 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC28A2O43868 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC28A2O43868 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC28A2O43868 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC28A2O43868 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC28A2O43868 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC28A2O43868 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC28A2O43868 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC28A2O43868 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC28A2O43868 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC28A2O43868 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC28A2O43868 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC28A2O43868 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC28A2O43868 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC28A2O43868 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC28A2O43868 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC28A2O43868 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC28A2O43868 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC28A2O43868 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC28A2O43868 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms