Protein–RNA interactions for Protein: O43435

TBX1, T-box transcription factor TBX1, humanhuman

Predictions only

Length 398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBX1O43435 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TBX1O43435 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TBX1O43435 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TBX1O43435 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TBX1O43435 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TBX1O43435 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TBX1O43435 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TBX1O43435 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TBX1O43435 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TBX1O43435 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TBX1O43435 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TBX1O43435 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TBX1O43435 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TBX1O43435 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TBX1O43435 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TBX1O43435 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TBX1O43435 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TBX1O43435 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TBX1O43435 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TBX1O43435 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TBX1O43435 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TBX1O43435 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TBX1O43435 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TBX1O43435 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TBX1O43435 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TBX1O43435 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TBX1O43435 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TBX1O43435 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TBX1O43435 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TBX1O43435 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TBX1O43435 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TBX1O43435 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TBX1O43435 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TBX1O43435 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TBX1O43435 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TBX1O43435 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TBX1O43435 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TBX1O43435 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TBX1O43435 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TBX1O43435 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TBX1O43435 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TBX1O43435 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TBX1O43435 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TBX1O43435 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TBX1O43435 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TBX1O43435 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TBX1O43435 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TBX1O43435 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TBX1O43435 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TBX1O43435 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TBX1O43435 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TBX1O43435 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TBX1O43435 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TBX1O43435 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TBX1O43435 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TBX1O43435 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TBX1O43435 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TBX1O43435 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TBX1O43435 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TBX1O43435 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TBX1O43435 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TBX1O43435 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TBX1O43435 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TBX1O43435 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TBX1O43435 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TBX1O43435 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TBX1O43435 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TBX1O43435 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TBX1O43435 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TBX1O43435 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TBX1O43435 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TBX1O43435 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TBX1O43435 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TBX1O43435 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TBX1O43435 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TBX1O43435 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TBX1O43435 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TBX1O43435 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TBX1O43435 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TBX1O43435 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TBX1O43435 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TBX1O43435 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TBX1O43435 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TBX1O43435 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TBX1O43435 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TBX1O43435 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TBX1O43435 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TBX1O43435 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TBX1O43435 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TBX1O43435 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TBX1O43435 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TBX1O43435 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TBX1O43435 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TBX1O43435 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TBX1O43435 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TBX1O43435 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TBX1O43435 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TBX1O43435 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TBX1O43435 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TBX1O43435 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms