Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LRRTM2O43300 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LRRTM2O43300 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LRRTM2O43300 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LRRTM2O43300 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LRRTM2O43300 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LRRTM2O43300 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LRRTM2O43300 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LRRTM2O43300 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LRRTM2O43300 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LRRTM2O43300 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LRRTM2O43300 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LRRTM2O43300 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LRRTM2O43300 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LRRTM2O43300 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LRRTM2O43300 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LRRTM2O43300 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LRRTM2O43300 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LRRTM2O43300 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LRRTM2O43300 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LRRTM2O43300 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LRRTM2O43300 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LRRTM2O43300 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LRRTM2O43300 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LRRTM2O43300 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LRRTM2O43300 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
LRRTM2O43300 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
LRRTM2O43300 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
LRRTM2O43300 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
LRRTM2O43300 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
LRRTM2O43300 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
LRRTM2O43300 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
LRRTM2O43300 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
LRRTM2O43300 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
LRRTM2O43300 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LRRTM2O43300 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LRRTM2O43300 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LRRTM2O43300 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LRRTM2O43300 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LRRTM2O43300 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRRTM2O43300 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRRTM2O43300 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRRTM2O43300 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
LRRTM2O43300 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LRRTM2O43300 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LRRTM2O43300 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRRTM2O43300 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRRTM2O43300 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRRTM2O43300 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRRTM2O43300 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRRTM2O43300 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRRTM2O43300 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRRTM2O43300 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRRTM2O43300 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRRTM2O43300 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRRTM2O43300 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRRTM2O43300 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LRRTM2O43300 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LRRTM2O43300 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LRRTM2O43300 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LRRTM2O43300 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LRRTM2O43300 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LRRTM2O43300 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRRTM2O43300 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRRTM2O43300 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRRTM2O43300 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRTM2O43300 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRTM2O43300 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRTM2O43300 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRTM2O43300 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRTM2O43300 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRTM2O43300 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRTM2O43300 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRTM2O43300 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRRTM2O43300 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRRTM2O43300 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRRTM2O43300 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRRTM2O43300 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRRTM2O43300 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRTM2O43300 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRTM2O43300 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRTM2O43300 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRTM2O43300 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRRTM2O43300 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRRTM2O43300 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRRTM2O43300 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
LRRTM2O43300 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRRTM2O43300 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRRTM2O43300 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRRTM2O43300 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRRTM2O43300 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRRTM2O43300 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRRTM2O43300 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRRTM2O43300 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRRTM2O43300 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRRTM2O43300 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRTM2O43300 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRTM2O43300 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRTM2O43300 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRTM2O43300 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms