Protein–RNA interactions for Protein: O43237

DYNC1LI2, Cytoplasmic dynein 1 light intermediate chain 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DYNC1LI2O43237 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
DYNC1LI2O43237 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
DYNC1LI2O43237 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
DYNC1LI2O43237 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
DYNC1LI2O43237 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
DYNC1LI2O43237 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
DYNC1LI2O43237 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
DYNC1LI2O43237 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
DYNC1LI2O43237 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
DYNC1LI2O43237 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
DYNC1LI2O43237 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
DYNC1LI2O43237 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
DYNC1LI2O43237 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
DYNC1LI2O43237 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
DYNC1LI2O43237 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
DYNC1LI2O43237 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
DYNC1LI2O43237 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
DYNC1LI2O43237 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
DYNC1LI2O43237 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
DYNC1LI2O43237 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
DYNC1LI2O43237 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
DYNC1LI2O43237 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
DYNC1LI2O43237 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
DYNC1LI2O43237 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
DYNC1LI2O43237 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
DYNC1LI2O43237 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
DYNC1LI2O43237 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
DYNC1LI2O43237 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
DYNC1LI2O43237 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
DYNC1LI2O43237 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
DYNC1LI2O43237 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
DYNC1LI2O43237 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
DYNC1LI2O43237 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
DYNC1LI2O43237 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
DYNC1LI2O43237 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
DYNC1LI2O43237 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
DYNC1LI2O43237 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
DYNC1LI2O43237 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
DYNC1LI2O43237 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
DYNC1LI2O43237 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.21
DYNC1LI2O43237 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
DYNC1LI2O43237 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
DYNC1LI2O43237 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
DYNC1LI2O43237 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
DYNC1LI2O43237 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
DYNC1LI2O43237 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
DYNC1LI2O43237 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
DYNC1LI2O43237 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
DYNC1LI2O43237 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
DYNC1LI2O43237 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
DYNC1LI2O43237 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
DYNC1LI2O43237 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
DYNC1LI2O43237 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
DYNC1LI2O43237 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
DYNC1LI2O43237 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
DYNC1LI2O43237 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
DYNC1LI2O43237 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
DYNC1LI2O43237 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
DYNC1LI2O43237 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
DYNC1LI2O43237 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
DYNC1LI2O43237 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
DYNC1LI2O43237 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
DYNC1LI2O43237 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
DYNC1LI2O43237 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
DYNC1LI2O43237 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
DYNC1LI2O43237 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
DYNC1LI2O43237 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
DYNC1LI2O43237 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
DYNC1LI2O43237 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
DYNC1LI2O43237 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
DYNC1LI2O43237 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
DYNC1LI2O43237 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
DYNC1LI2O43237 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
DYNC1LI2O43237 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
DYNC1LI2O43237 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
DYNC1LI2O43237 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
DYNC1LI2O43237 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
DYNC1LI2O43237 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
DYNC1LI2O43237 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
DYNC1LI2O43237 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
DYNC1LI2O43237 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
DYNC1LI2O43237 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
DYNC1LI2O43237 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
DYNC1LI2O43237 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
DYNC1LI2O43237 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
DYNC1LI2O43237 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
DYNC1LI2O43237 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
DYNC1LI2O43237 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
DYNC1LI2O43237 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
DYNC1LI2O43237 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
DYNC1LI2O43237 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
DYNC1LI2O43237 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
DYNC1LI2O43237 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
DYNC1LI2O43237 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
DYNC1LI2O43237 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
DYNC1LI2O43237 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
DYNC1LI2O43237 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
DYNC1LI2O43237 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
DYNC1LI2O43237 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
DYNC1LI2O43237 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 127.3 ms