Protein–RNA interactions for Protein: O15550

KDM6A, Lysine-specific demethylase 6A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,401 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM6AO15550 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC33.8■■■■□ 3
KDM6AO15550 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC33.79■■■■□ 3
KDM6AO15550 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
KDM6AO15550 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
KDM6AO15550 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
KDM6AO15550 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
KDM6AO15550 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
KDM6AO15550 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
KDM6AO15550 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC33.74■■■□□ 2.99
KDM6AO15550 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
KDM6AO15550 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
KDM6AO15550 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
KDM6AO15550 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
KDM6AO15550 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
KDM6AO15550 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC33.71■■■□□ 2.99
KDM6AO15550 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
KDM6AO15550 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.7■■■□□ 2.99
KDM6AO15550 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.7■■■□□ 2.98
KDM6AO15550 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
KDM6AO15550 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
KDM6AO15550 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
KDM6AO15550 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
KDM6AO15550 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
KDM6AO15550 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
KDM6AO15550 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
KDM6AO15550 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
KDM6AO15550 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
KDM6AO15550 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
KDM6AO15550 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
KDM6AO15550 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC33.66■■■□□ 2.98
KDM6AO15550 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC33.66■■■□□ 2.98
KDM6AO15550 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
KDM6AO15550 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
KDM6AO15550 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
KDM6AO15550 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
KDM6AO15550 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
KDM6AO15550 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
KDM6AO15550 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
KDM6AO15550 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
KDM6AO15550 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
KDM6AO15550 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.62■■■□□ 2.97
KDM6AO15550 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
KDM6AO15550 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
KDM6AO15550 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
KDM6AO15550 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
KDM6AO15550 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
KDM6AO15550 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
KDM6AO15550 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
KDM6AO15550 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
KDM6AO15550 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
KDM6AO15550 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC33.59■■■□□ 2.97
KDM6AO15550 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
KDM6AO15550 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
KDM6AO15550 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
KDM6AO15550 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
KDM6AO15550 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
KDM6AO15550 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
KDM6AO15550 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
KDM6AO15550 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC33.57■■■□□ 2.96
KDM6AO15550 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC33.57■■■□□ 2.96
KDM6AO15550 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
KDM6AO15550 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
KDM6AO15550 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
KDM6AO15550 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
KDM6AO15550 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
KDM6AO15550 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
KDM6AO15550 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
KDM6AO15550 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
KDM6AO15550 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
KDM6AO15550 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC33.54■■■□□ 2.96
KDM6AO15550 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
KDM6AO15550 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
KDM6AO15550 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
KDM6AO15550 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
KDM6AO15550 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
KDM6AO15550 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
KDM6AO15550 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC33.51■■■□□ 2.96
KDM6AO15550 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
KDM6AO15550 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
KDM6AO15550 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
KDM6AO15550 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC33.5■■■□□ 2.95
KDM6AO15550 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
KDM6AO15550 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
KDM6AO15550 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
KDM6AO15550 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
KDM6AO15550 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
KDM6AO15550 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
KDM6AO15550 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
KDM6AO15550 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
KDM6AO15550 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC33.47■■■□□ 2.95
KDM6AO15550 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
KDM6AO15550 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC33.47■■■□□ 2.95
KDM6AO15550 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
KDM6AO15550 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
KDM6AO15550 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
KDM6AO15550 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
KDM6AO15550 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
KDM6AO15550 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
KDM6AO15550 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
KDM6AO15550 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms