Protein–RNA interactions for Protein: O15522

NKX2-8, Homeobox protein Nkx-2.8, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX2-8O15522 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NKX2-8O15522 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
NKX2-8O15522 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NKX2-8O15522 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NKX2-8O15522 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NKX2-8O15522 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
NKX2-8O15522 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NKX2-8O15522 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NKX2-8O15522 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NKX2-8O15522 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NKX2-8O15522 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NKX2-8O15522 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NKX2-8O15522 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NKX2-8O15522 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
NKX2-8O15522 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NKX2-8O15522 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NKX2-8O15522 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NKX2-8O15522 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NKX2-8O15522 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NKX2-8O15522 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
NKX2-8O15522 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NKX2-8O15522 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NKX2-8O15522 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NKX2-8O15522 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NKX2-8O15522 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NKX2-8O15522 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NKX2-8O15522 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NKX2-8O15522 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NKX2-8O15522 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NKX2-8O15522 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NKX2-8O15522 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NKX2-8O15522 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NKX2-8O15522 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
NKX2-8O15522 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24■■□□□ 1.43
NKX2-8O15522 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NKX2-8O15522 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NKX2-8O15522 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NKX2-8O15522 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NKX2-8O15522 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NKX2-8O15522 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NKX2-8O15522 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NKX2-8O15522 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NKX2-8O15522 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NKX2-8O15522 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NKX2-8O15522 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NKX2-8O15522 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
NKX2-8O15522 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
NKX2-8O15522 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NKX2-8O15522 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NKX2-8O15522 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
NKX2-8O15522 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NKX2-8O15522 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
NKX2-8O15522 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NKX2-8O15522 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NKX2-8O15522 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NKX2-8O15522 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NKX2-8O15522 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NKX2-8O15522 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NKX2-8O15522 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
NKX2-8O15522 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NKX2-8O15522 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NKX2-8O15522 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NKX2-8O15522 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
NKX2-8O15522 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
NKX2-8O15522 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NKX2-8O15522 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NKX2-8O15522 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NKX2-8O15522 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NKX2-8O15522 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
NKX2-8O15522 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NKX2-8O15522 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NKX2-8O15522 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NKX2-8O15522 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NKX2-8O15522 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
NKX2-8O15522 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NKX2-8O15522 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NKX2-8O15522 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NKX2-8O15522 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NKX2-8O15522 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NKX2-8O15522 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NKX2-8O15522 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NKX2-8O15522 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
NKX2-8O15522 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NKX2-8O15522 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NKX2-8O15522 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NKX2-8O15522 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NKX2-8O15522 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NKX2-8O15522 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NKX2-8O15522 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NKX2-8O15522 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NKX2-8O15522 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NKX2-8O15522 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NKX2-8O15522 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NKX2-8O15522 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NKX2-8O15522 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NKX2-8O15522 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NKX2-8O15522 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NKX2-8O15522 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NKX2-8O15522 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NKX2-8O15522 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms