Protein–RNA interactions for Protein: O14595

CTDSP2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2O14595 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CTDSP2O14595 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CTDSP2O14595 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CTDSP2O14595 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CTDSP2O14595 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CTDSP2O14595 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTDSP2O14595 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTDSP2O14595 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTDSP2O14595 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTDSP2O14595 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CTDSP2O14595 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTDSP2O14595 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTDSP2O14595 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTDSP2O14595 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTDSP2O14595 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTDSP2O14595 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTDSP2O14595 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTDSP2O14595 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTDSP2O14595 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTDSP2O14595 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTDSP2O14595 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTDSP2O14595 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTDSP2O14595 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CTDSP2O14595 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CTDSP2O14595 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTDSP2O14595 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTDSP2O14595 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTDSP2O14595 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTDSP2O14595 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTDSP2O14595 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTDSP2O14595 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTDSP2O14595 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTDSP2O14595 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CTDSP2O14595 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTDSP2O14595 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTDSP2O14595 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTDSP2O14595 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTDSP2O14595 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTDSP2O14595 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTDSP2O14595 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTDSP2O14595 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTDSP2O14595 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTDSP2O14595 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTDSP2O14595 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTDSP2O14595 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTDSP2O14595 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTDSP2O14595 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTDSP2O14595 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTDSP2O14595 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTDSP2O14595 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTDSP2O14595 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTDSP2O14595 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTDSP2O14595 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTDSP2O14595 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTDSP2O14595 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTDSP2O14595 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CTDSP2O14595 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CTDSP2O14595 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CTDSP2O14595 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTDSP2O14595 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTDSP2O14595 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTDSP2O14595 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTDSP2O14595 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTDSP2O14595 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTDSP2O14595 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CTDSP2O14595 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTDSP2O14595 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTDSP2O14595 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTDSP2O14595 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTDSP2O14595 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTDSP2O14595 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTDSP2O14595 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTDSP2O14595 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTDSP2O14595 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTDSP2O14595 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTDSP2O14595 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTDSP2O14595 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTDSP2O14595 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTDSP2O14595 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTDSP2O14595 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CTDSP2O14595 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTDSP2O14595 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTDSP2O14595 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTDSP2O14595 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTDSP2O14595 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CTDSP2O14595 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CTDSP2O14595 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CTDSP2O14595 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTDSP2O14595 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTDSP2O14595 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTDSP2O14595 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTDSP2O14595 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTDSP2O14595 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTDSP2O14595 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTDSP2O14595 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTDSP2O14595 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTDSP2O14595 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTDSP2O14595 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTDSP2O14595 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTDSP2O14595 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.8 ms