Protein–RNA interactions for Protein: O14529

CUX2, Homeobox protein cut-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,486 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUX2O14529 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.34■■■■■ 4.85
CUX2O14529 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC45.34■■■■■ 4.85
CUX2O14529 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.34■■■■■ 4.85
CUX2O14529 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC45.33■■■■■ 4.85
CUX2O14529 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC45.33■■■■■ 4.85
CUX2O14529 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC45.33■■■■■ 4.85
CUX2O14529 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC45.31■■■■■ 4.84
CUX2O14529 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.31■■■■■ 4.84
CUX2O14529 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.3■■■■■ 4.84
CUX2O14529 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC45.3■■■■■ 4.84
CUX2O14529 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC45.3■■■■■ 4.84
CUX2O14529 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC45.28■■■■■ 4.84
CUX2O14529 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.28■■■■■ 4.84
CUX2O14529 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC45.28■■■■■ 4.84
CUX2O14529 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.25■■■■■ 4.83
CUX2O14529 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC45.25■■■■■ 4.83
CUX2O14529 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC45.24■■■■■ 4.83
CUX2O14529 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC45.24■■■■■ 4.83
CUX2O14529 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC45.23■■■■■ 4.83
CUX2O14529 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC45.22■■■■■ 4.83
CUX2O14529 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.21■■■■■ 4.83
CUX2O14529 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC45.21■■■■■ 4.83
CUX2O14529 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.2■■■■■ 4.83
CUX2O14529 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC45.2■■■■■ 4.83
CUX2O14529 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC45.2■■■■■ 4.83
CUX2O14529 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC45.19■■■■■ 4.82
CUX2O14529 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC45.18■■■■■ 4.82
CUX2O14529 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC45.18■■■■■ 4.82
CUX2O14529 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC45.18■■■■■ 4.82
CUX2O14529 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC45.17■■■■■ 4.82
CUX2O14529 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC45.17■■■■■ 4.82
CUX2O14529 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC45.17■■■■■ 4.82
CUX2O14529 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC45.16■■■■■ 4.82
CUX2O14529 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.14■■■■■ 4.82
CUX2O14529 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC45.14■■■■■ 4.82
CUX2O14529 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.14■■■■■ 4.82
CUX2O14529 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.13■■■■■ 4.82
CUX2O14529 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC45.13■■■■■ 4.82
CUX2O14529 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC45.12■■■■■ 4.81
CUX2O14529 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.1■■■■■ 4.81
CUX2O14529 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC45.1■■■■■ 4.81
CUX2O14529 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.1■■■■■ 4.81
CUX2O14529 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.09■■■■■ 4.81
CUX2O14529 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.08■■■■■ 4.81
CUX2O14529 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC45.08■■■■■ 4.81
CUX2O14529 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC45.07■■■■■ 4.8
CUX2O14529 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC45.06■■■■■ 4.8
CUX2O14529 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC45.06■■■■■ 4.8
CUX2O14529 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC45.05■■■■■ 4.8
CUX2O14529 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.05■■■■■ 4.8
CUX2O14529 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.05■■■■■ 4.8
CUX2O14529 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.04■■■■■ 4.8
CUX2O14529 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.04■■■■■ 4.8
CUX2O14529 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC45.04■■■■■ 4.8
CUX2O14529 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.04■■■■■ 4.8
CUX2O14529 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.03■■■■■ 4.8
CUX2O14529 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.02■■■■■ 4.8
CUX2O14529 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC45.02■■■■■ 4.8
CUX2O14529 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC45.02■■■■■ 4.8
CUX2O14529 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC45.02■■■■■ 4.8
CUX2O14529 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC45.02■■■■■ 4.8
CUX2O14529 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.02■■■■■ 4.8
CUX2O14529 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45■■■■■ 4.79
CUX2O14529 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC45■■■■■ 4.79
CUX2O14529 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC44.99■■■■■ 4.79
CUX2O14529 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC44.98■■■■■ 4.79
CUX2O14529 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC44.97■■■■■ 4.79
CUX2O14529 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC44.97■■■■■ 4.79
CUX2O14529 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC44.96■■■■■ 4.79
CUX2O14529 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.95■■■■■ 4.79
CUX2O14529 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC44.95■■■■■ 4.79
CUX2O14529 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC44.95■■■■■ 4.79
CUX2O14529 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.94■■■■■ 4.78
CUX2O14529 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC44.94■■■■■ 4.78
CUX2O14529 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC44.94■■■■■ 4.78
CUX2O14529 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC44.93■■■■■ 4.78
CUX2O14529 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC44.93■■■■■ 4.78
CUX2O14529 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.92■■■■■ 4.78
CUX2O14529 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.92■■■■■ 4.78
CUX2O14529 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC44.92■■■■■ 4.78
CUX2O14529 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.91■■■■■ 4.78
CUX2O14529 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.91■■■■■ 4.78
CUX2O14529 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC44.91■■■■■ 4.78
CUX2O14529 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC44.91■■■■■ 4.78
CUX2O14529 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.9■■■■■ 4.78
CUX2O14529 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC44.9■■■■■ 4.78
CUX2O14529 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC44.9■■■■■ 4.78
CUX2O14529 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC44.89■■■■■ 4.78
CUX2O14529 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC44.87■■■■■ 4.77
CUX2O14529 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC44.87■■■■■ 4.77
CUX2O14529 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.87■■■■■ 4.77
CUX2O14529 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC44.86■■■■■ 4.77
CUX2O14529 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC44.85■■■■■ 4.77
CUX2O14529 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.85■■■■■ 4.77
CUX2O14529 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC44.84■■■■■ 4.77
CUX2O14529 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC44.84■■■■■ 4.77
CUX2O14529 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC44.84■■■■■ 4.77
CUX2O14529 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC44.84■■■■■ 4.77
CUX2O14529 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC44.84■■■■■ 4.77
CUX2O14529 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.84■■■■■ 4.77
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