Protein–RNA interactions for Protein: O00339

MATN2, Matrilin-2, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MATN2O00339 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MATN2O00339 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MATN2O00339 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MATN2O00339 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MATN2O00339 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MATN2O00339 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MATN2O00339 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MATN2O00339 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MATN2O00339 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MATN2O00339 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MATN2O00339 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MATN2O00339 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MATN2O00339 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MATN2O00339 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
MATN2O00339 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MATN2O00339 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MATN2O00339 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MATN2O00339 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MATN2O00339 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MATN2O00339 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MATN2O00339 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MATN2O00339 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
MATN2O00339 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MATN2O00339 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MATN2O00339 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MATN2O00339 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MATN2O00339 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MATN2O00339 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MATN2O00339 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MATN2O00339 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MATN2O00339 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MATN2O00339 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MATN2O00339 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MATN2O00339 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MATN2O00339 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MATN2O00339 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MATN2O00339 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MATN2O00339 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MATN2O00339 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MATN2O00339 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MATN2O00339 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MATN2O00339 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MATN2O00339 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MATN2O00339 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MATN2O00339 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MATN2O00339 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MATN2O00339 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MATN2O00339 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
MATN2O00339 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MATN2O00339 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MATN2O00339 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MATN2O00339 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MATN2O00339 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MATN2O00339 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MATN2O00339 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MATN2O00339 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MATN2O00339 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MATN2O00339 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MATN2O00339 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
MATN2O00339 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MATN2O00339 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MATN2O00339 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MATN2O00339 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MATN2O00339 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MATN2O00339 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MATN2O00339 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MATN2O00339 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MATN2O00339 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MATN2O00339 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
MATN2O00339 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MATN2O00339 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MATN2O00339 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MATN2O00339 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MATN2O00339 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MATN2O00339 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MATN2O00339 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MATN2O00339 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MATN2O00339 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MATN2O00339 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MATN2O00339 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MATN2O00339 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MATN2O00339 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MATN2O00339 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MATN2O00339 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MATN2O00339 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MATN2O00339 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MATN2O00339 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MATN2O00339 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MATN2O00339 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MATN2O00339 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MATN2O00339 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MATN2O00339 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MATN2O00339 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MATN2O00339 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MATN2O00339 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MATN2O00339 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MATN2O00339 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MATN2O00339 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MATN2O00339 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MATN2O00339 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms