Protein–RNA interactions for Protein: K7ERE1

TMEM256-PLSCR3, TMEM256-PLSCR3 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 68 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms