Protein–RNA interactions for Protein: H3BVE0

BOLA2-SMG1P6, BOLA2-SMG1P6 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms