Protein–RNA interactions for Protein: F8W1W9

NPIPB9, Nuclear pore complex-interacting protein family member B9, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB9F8W1W9 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NPIPB9F8W1W9 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NPIPB9F8W1W9 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NPIPB9F8W1W9 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NPIPB9F8W1W9 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
NPIPB9F8W1W9 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NPIPB9F8W1W9 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NPIPB9F8W1W9 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NPIPB9F8W1W9 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NPIPB9F8W1W9 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NPIPB9F8W1W9 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
NPIPB9F8W1W9 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NPIPB9F8W1W9 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NPIPB9F8W1W9 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NPIPB9F8W1W9 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
NPIPB9F8W1W9 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NPIPB9F8W1W9 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NPIPB9F8W1W9 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NPIPB9F8W1W9 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NPIPB9F8W1W9 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NPIPB9F8W1W9 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NPIPB9F8W1W9 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NPIPB9F8W1W9 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NPIPB9F8W1W9 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NPIPB9F8W1W9 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NPIPB9F8W1W9 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NPIPB9F8W1W9 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NPIPB9F8W1W9 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NPIPB9F8W1W9 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NPIPB9F8W1W9 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NPIPB9F8W1W9 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NPIPB9F8W1W9 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NPIPB9F8W1W9 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NPIPB9F8W1W9 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NPIPB9F8W1W9 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NPIPB9F8W1W9 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
NPIPB9F8W1W9 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NPIPB9F8W1W9 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NPIPB9F8W1W9 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NPIPB9F8W1W9 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NPIPB9F8W1W9 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NPIPB9F8W1W9 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NPIPB9F8W1W9 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NPIPB9F8W1W9 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NPIPB9F8W1W9 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NPIPB9F8W1W9 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NPIPB9F8W1W9 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NPIPB9F8W1W9 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NPIPB9F8W1W9 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NPIPB9F8W1W9 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NPIPB9F8W1W9 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NPIPB9F8W1W9 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NPIPB9F8W1W9 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NPIPB9F8W1W9 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NPIPB9F8W1W9 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
NPIPB9F8W1W9 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NPIPB9F8W1W9 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NPIPB9F8W1W9 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NPIPB9F8W1W9 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
NPIPB9F8W1W9 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NPIPB9F8W1W9 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NPIPB9F8W1W9 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NPIPB9F8W1W9 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NPIPB9F8W1W9 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NPIPB9F8W1W9 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NPIPB9F8W1W9 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NPIPB9F8W1W9 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NPIPB9F8W1W9 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NPIPB9F8W1W9 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NPIPB9F8W1W9 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NPIPB9F8W1W9 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NPIPB9F8W1W9 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NPIPB9F8W1W9 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NPIPB9F8W1W9 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
NPIPB9F8W1W9 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NPIPB9F8W1W9 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NPIPB9F8W1W9 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NPIPB9F8W1W9 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NPIPB9F8W1W9 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NPIPB9F8W1W9 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NPIPB9F8W1W9 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NPIPB9F8W1W9 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NPIPB9F8W1W9 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NPIPB9F8W1W9 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NPIPB9F8W1W9 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NPIPB9F8W1W9 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NPIPB9F8W1W9 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NPIPB9F8W1W9 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NPIPB9F8W1W9 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NPIPB9F8W1W9 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NPIPB9F8W1W9 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NPIPB9F8W1W9 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NPIPB9F8W1W9 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NPIPB9F8W1W9 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NPIPB9F8W1W9 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NPIPB9F8W1W9 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NPIPB9F8W1W9 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NPIPB9F8W1W9 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NPIPB9F8W1W9 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NPIPB9F8W1W9 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.2 ms