Protein–RNA interactions for Protein: C9JE40

PATL2, Protein PAT1 homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATL2C9JE40 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
PATL2C9JE40 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
PATL2C9JE40 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
PATL2C9JE40 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
PATL2C9JE40 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
PATL2C9JE40 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
PATL2C9JE40 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
PATL2C9JE40 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
PATL2C9JE40 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
PATL2C9JE40 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
PATL2C9JE40 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
PATL2C9JE40 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
PATL2C9JE40 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
PATL2C9JE40 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC30.73■■■□□ 2.51
PATL2C9JE40 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
PATL2C9JE40 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
PATL2C9JE40 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
PATL2C9JE40 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
PATL2C9JE40 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
PATL2C9JE40 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
PATL2C9JE40 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC30.71■■■□□ 2.51
PATL2C9JE40 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
PATL2C9JE40 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
PATL2C9JE40 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
PATL2C9JE40 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
PATL2C9JE40 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
PATL2C9JE40 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
PATL2C9JE40 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC30.69■■■□□ 2.5
PATL2C9JE40 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
PATL2C9JE40 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC30.68■■■□□ 2.5
PATL2C9JE40 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
PATL2C9JE40 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC30.67■■■□□ 2.5
PATL2C9JE40 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
PATL2C9JE40 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC30.67■■■□□ 2.5
PATL2C9JE40 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC30.67■■■□□ 2.5
PATL2C9JE40 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
PATL2C9JE40 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
PATL2C9JE40 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
PATL2C9JE40 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
PATL2C9JE40 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
PATL2C9JE40 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
PATL2C9JE40 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
PATL2C9JE40 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC30.66■■■□□ 2.5
PATL2C9JE40 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
PATL2C9JE40 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
PATL2C9JE40 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
PATL2C9JE40 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
PATL2C9JE40 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
PATL2C9JE40 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
PATL2C9JE40 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
PATL2C9JE40 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
PATL2C9JE40 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
PATL2C9JE40 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
PATL2C9JE40 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
PATL2C9JE40 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
PATL2C9JE40 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
PATL2C9JE40 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
PATL2C9JE40 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
PATL2C9JE40 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
PATL2C9JE40 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC30.61■■■□□ 2.49
PATL2C9JE40 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
PATL2C9JE40 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
PATL2C9JE40 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
PATL2C9JE40 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
PATL2C9JE40 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
PATL2C9JE40 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
PATL2C9JE40 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
PATL2C9JE40 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC30.58■■■□□ 2.49
PATL2C9JE40 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
PATL2C9JE40 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC30.58■■■□□ 2.49
PATL2C9JE40 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
PATL2C9JE40 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
PATL2C9JE40 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
PATL2C9JE40 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
PATL2C9JE40 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
PATL2C9JE40 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
PATL2C9JE40 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
PATL2C9JE40 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC30.56■■■□□ 2.48
PATL2C9JE40 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
PATL2C9JE40 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
PATL2C9JE40 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
PATL2C9JE40 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
PATL2C9JE40 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
PATL2C9JE40 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
PATL2C9JE40 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
PATL2C9JE40 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
PATL2C9JE40 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
PATL2C9JE40 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
PATL2C9JE40 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
PATL2C9JE40 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
PATL2C9JE40 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
PATL2C9JE40 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
PATL2C9JE40 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
PATL2C9JE40 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
PATL2C9JE40 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
PATL2C9JE40 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
PATL2C9JE40 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
PATL2C9JE40 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
PATL2C9JE40 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
PATL2C9JE40 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms