Protein–RNA interactions for Protein: C9IYK1

Gap junction protein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9IYK1 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
C9IYK1 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
C9IYK1 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
C9IYK1 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
C9IYK1 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
C9IYK1 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
C9IYK1 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
C9IYK1 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
C9IYK1 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
C9IYK1 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
C9IYK1 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
C9IYK1 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
C9IYK1 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
C9IYK1 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
C9IYK1 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
C9IYK1 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
C9IYK1 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
C9IYK1 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
C9IYK1 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
C9IYK1 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
C9IYK1 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
C9IYK1 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
C9IYK1 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
C9IYK1 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
C9IYK1 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
C9IYK1 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
C9IYK1 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
C9IYK1 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
C9IYK1 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
C9IYK1 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
C9IYK1 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC28■■■□□ 2.07
C9IYK1 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
C9IYK1 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
C9IYK1 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
C9IYK1 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
C9IYK1 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
C9IYK1 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
C9IYK1 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
C9IYK1 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
C9IYK1 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
C9IYK1 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
C9IYK1 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
C9IYK1 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
C9IYK1 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
C9IYK1 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
C9IYK1 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
C9IYK1 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
C9IYK1 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
C9IYK1 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
C9IYK1 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
C9IYK1 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
C9IYK1 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
C9IYK1 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
C9IYK1 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
C9IYK1 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
C9IYK1 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
C9IYK1 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
C9IYK1 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
C9IYK1 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
C9IYK1 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
C9IYK1 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
C9IYK1 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
C9IYK1 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
C9IYK1 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
C9IYK1 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
C9IYK1 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
C9IYK1 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
C9IYK1 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
C9IYK1 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
C9IYK1 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
C9IYK1 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
C9IYK1 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
C9IYK1 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
C9IYK1 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
C9IYK1 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
C9IYK1 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
C9IYK1 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
C9IYK1 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
C9IYK1 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
C9IYK1 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
C9IYK1 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
C9IYK1 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
C9IYK1 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
C9IYK1 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
C9IYK1 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
C9IYK1 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
C9IYK1 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
C9IYK1 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
C9IYK1 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
C9IYK1 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
C9IYK1 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
C9IYK1 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
C9IYK1 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
C9IYK1 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
C9IYK1 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
C9IYK1 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
C9IYK1 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
C9IYK1 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
C9IYK1 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
C9IYK1 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms