Protein–RNA interactions for Protein: B4DSR2

cDNA FLJ52234, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DSR2 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
B4DSR2 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
B4DSR2 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
B4DSR2 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
B4DSR2 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
B4DSR2 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
B4DSR2 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
B4DSR2 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
B4DSR2 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
B4DSR2 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
B4DSR2 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
B4DSR2 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
B4DSR2 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
B4DSR2 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
B4DSR2 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
B4DSR2 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
B4DSR2 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
B4DSR2 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
B4DSR2 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
B4DSR2 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
B4DSR2 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
B4DSR2 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
B4DSR2 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
B4DSR2 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
B4DSR2 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
B4DSR2 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
B4DSR2 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
B4DSR2 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
B4DSR2 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
B4DSR2 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
B4DSR2 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
B4DSR2 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
B4DSR2 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
B4DSR2 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
B4DSR2 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
B4DSR2 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
B4DSR2 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
B4DSR2 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
B4DSR2 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
B4DSR2 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
B4DSR2 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
B4DSR2 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
B4DSR2 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
B4DSR2 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
B4DSR2 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
B4DSR2 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
B4DSR2 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
B4DSR2 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
B4DSR2 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
B4DSR2 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
B4DSR2 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
B4DSR2 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
B4DSR2 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
B4DSR2 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
B4DSR2 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
B4DSR2 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
B4DSR2 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
B4DSR2 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
B4DSR2 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
B4DSR2 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
B4DSR2 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
B4DSR2 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
B4DSR2 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
B4DSR2 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
B4DSR2 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
B4DSR2 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
B4DSR2 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
B4DSR2 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
B4DSR2 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
B4DSR2 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
B4DSR2 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
B4DSR2 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
B4DSR2 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
B4DSR2 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
B4DSR2 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
B4DSR2 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
B4DSR2 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
B4DSR2 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
B4DSR2 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
B4DSR2 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
B4DSR2 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
B4DSR2 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
B4DSR2 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
B4DSR2 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
B4DSR2 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
B4DSR2 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
B4DSR2 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
B4DSR2 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
B4DSR2 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
B4DSR2 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
B4DSR2 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
B4DSR2 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
B4DSR2 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
B4DSR2 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
B4DSR2 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
B4DSR2 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
B4DSR2 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
B4DSR2 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
B4DSR2 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
B4DSR2 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms