Protein–RNA interactions for Protein: A6NM62

LRRC53, Leucine-rich repeat-containing protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 1,247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC53A6NM62 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
LRRC53A6NM62 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LRRC53A6NM62 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LRRC53A6NM62 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
LRRC53A6NM62 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LRRC53A6NM62 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LRRC53A6NM62 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LRRC53A6NM62 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
LRRC53A6NM62 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
LRRC53A6NM62 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LRRC53A6NM62 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
LRRC53A6NM62 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
LRRC53A6NM62 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
LRRC53A6NM62 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LRRC53A6NM62 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
LRRC53A6NM62 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LRRC53A6NM62 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
LRRC53A6NM62 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LRRC53A6NM62 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LRRC53A6NM62 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LRRC53A6NM62 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LRRC53A6NM62 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LRRC53A6NM62 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LRRC53A6NM62 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LRRC53A6NM62 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LRRC53A6NM62 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LRRC53A6NM62 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LRRC53A6NM62 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LRRC53A6NM62 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LRRC53A6NM62 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LRRC53A6NM62 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LRRC53A6NM62 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LRRC53A6NM62 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LRRC53A6NM62 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LRRC53A6NM62 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LRRC53A6NM62 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LRRC53A6NM62 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LRRC53A6NM62 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LRRC53A6NM62 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LRRC53A6NM62 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LRRC53A6NM62 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LRRC53A6NM62 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
LRRC53A6NM62 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LRRC53A6NM62 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
LRRC53A6NM62 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
LRRC53A6NM62 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.57■■■□□ 2
LRRC53A6NM62 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LRRC53A6NM62 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
LRRC53A6NM62 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LRRC53A6NM62 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LRRC53A6NM62 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LRRC53A6NM62 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LRRC53A6NM62 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.56■■■□□ 2
LRRC53A6NM62 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
LRRC53A6NM62 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LRRC53A6NM62 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LRRC53A6NM62 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LRRC53A6NM62 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LRRC53A6NM62 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
LRRC53A6NM62 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LRRC53A6NM62 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
LRRC53A6NM62 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LRRC53A6NM62 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LRRC53A6NM62 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
LRRC53A6NM62 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
LRRC53A6NM62 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
LRRC53A6NM62 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LRRC53A6NM62 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LRRC53A6NM62 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LRRC53A6NM62 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LRRC53A6NM62 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LRRC53A6NM62 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LRRC53A6NM62 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LRRC53A6NM62 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LRRC53A6NM62 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LRRC53A6NM62 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
LRRC53A6NM62 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
LRRC53A6NM62 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
LRRC53A6NM62 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
LRRC53A6NM62 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LRRC53A6NM62 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LRRC53A6NM62 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LRRC53A6NM62 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
LRRC53A6NM62 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LRRC53A6NM62 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LRRC53A6NM62 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LRRC53A6NM62 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
LRRC53A6NM62 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
LRRC53A6NM62 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
LRRC53A6NM62 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
LRRC53A6NM62 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LRRC53A6NM62 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
LRRC53A6NM62 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LRRC53A6NM62 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LRRC53A6NM62 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
LRRC53A6NM62 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
LRRC53A6NM62 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LRRC53A6NM62 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LRRC53A6NM62 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LRRC53A6NM62 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms