Protein–RNA interactions for Protein: A6NM43

CCT8L1P, Putative T-complex protein 1 subunit theta-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT8L1PA6NM43 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCT8L1PA6NM43 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCT8L1PA6NM43 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCT8L1PA6NM43 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCT8L1PA6NM43 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCT8L1PA6NM43 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCT8L1PA6NM43 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCT8L1PA6NM43 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CCT8L1PA6NM43 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCT8L1PA6NM43 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCT8L1PA6NM43 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCT8L1PA6NM43 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCT8L1PA6NM43 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCT8L1PA6NM43 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCT8L1PA6NM43 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCT8L1PA6NM43 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCT8L1PA6NM43 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCT8L1PA6NM43 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCT8L1PA6NM43 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCT8L1PA6NM43 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCT8L1PA6NM43 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCT8L1PA6NM43 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCT8L1PA6NM43 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCT8L1PA6NM43 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCT8L1PA6NM43 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCT8L1PA6NM43 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCT8L1PA6NM43 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCT8L1PA6NM43 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCT8L1PA6NM43 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CCT8L1PA6NM43 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCT8L1PA6NM43 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCT8L1PA6NM43 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCT8L1PA6NM43 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCT8L1PA6NM43 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCT8L1PA6NM43 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCT8L1PA6NM43 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCT8L1PA6NM43 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCT8L1PA6NM43 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCT8L1PA6NM43 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCT8L1PA6NM43 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCT8L1PA6NM43 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CCT8L1PA6NM43 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CCT8L1PA6NM43 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCT8L1PA6NM43 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CCT8L1PA6NM43 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCT8L1PA6NM43 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCT8L1PA6NM43 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCT8L1PA6NM43 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCT8L1PA6NM43 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCT8L1PA6NM43 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCT8L1PA6NM43 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCT8L1PA6NM43 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCT8L1PA6NM43 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCT8L1PA6NM43 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCT8L1PA6NM43 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCT8L1PA6NM43 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCT8L1PA6NM43 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCT8L1PA6NM43 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCT8L1PA6NM43 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCT8L1PA6NM43 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCT8L1PA6NM43 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCT8L1PA6NM43 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CCT8L1PA6NM43 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCT8L1PA6NM43 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCT8L1PA6NM43 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCT8L1PA6NM43 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCT8L1PA6NM43 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCT8L1PA6NM43 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCT8L1PA6NM43 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCT8L1PA6NM43 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCT8L1PA6NM43 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCT8L1PA6NM43 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCT8L1PA6NM43 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCT8L1PA6NM43 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCT8L1PA6NM43 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCT8L1PA6NM43 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCT8L1PA6NM43 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCT8L1PA6NM43 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCT8L1PA6NM43 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCT8L1PA6NM43 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCT8L1PA6NM43 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCT8L1PA6NM43 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCT8L1PA6NM43 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCT8L1PA6NM43 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCT8L1PA6NM43 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCT8L1PA6NM43 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCT8L1PA6NM43 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCT8L1PA6NM43 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CCT8L1PA6NM43 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CCT8L1PA6NM43 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CCT8L1PA6NM43 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCT8L1PA6NM43 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCT8L1PA6NM43 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCT8L1PA6NM43 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCT8L1PA6NM43 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCT8L1PA6NM43 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCT8L1PA6NM43 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCT8L1PA6NM43 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCT8L1PA6NM43 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCT8L1PA6NM43 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms