Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC40.93■■■■■ 4.14
ARID3CA6NKF2 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC40.92■■■■■ 4.14
ARID3CA6NKF2 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC40.92■■■■■ 4.14
ARID3CA6NKF2 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.91■■■■■ 4.14
ARID3CA6NKF2 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC40.9■■■■■ 4.14
ARID3CA6NKF2 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.9■■■■■ 4.14
ARID3CA6NKF2 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC40.89■■■■■ 4.14
ARID3CA6NKF2 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.89■■■■■ 4.14
ARID3CA6NKF2 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.88■■■■■ 4.14
ARID3CA6NKF2 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC40.88■■■■■ 4.14
ARID3CA6NKF2 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC40.87■■■■■ 4.13
ARID3CA6NKF2 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.86■■■■■ 4.13
ARID3CA6NKF2 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC40.84■■■■■ 4.13
ARID3CA6NKF2 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC40.84■■■■■ 4.13
ARID3CA6NKF2 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC40.84■■■■■ 4.13
ARID3CA6NKF2 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
ARID3CA6NKF2 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC40.83■■■■■ 4.13
ARID3CA6NKF2 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
ARID3CA6NKF2 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
ARID3CA6NKF2 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.82■■■■■ 4.13
ARID3CA6NKF2 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.81■■■■■ 4.12
ARID3CA6NKF2 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC40.8■■■■■ 4.12
ARID3CA6NKF2 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC40.8■■■■■ 4.12
ARID3CA6NKF2 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.8■■■■■ 4.12
ARID3CA6NKF2 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC40.78■■■■■ 4.12
ARID3CA6NKF2 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC40.78■■■■■ 4.12
ARID3CA6NKF2 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC40.78■■■■■ 4.12
ARID3CA6NKF2 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.78■■■■■ 4.12
ARID3CA6NKF2 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC40.77■■■■■ 4.12
ARID3CA6NKF2 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC40.77■■■■■ 4.12
ARID3CA6NKF2 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.76■■■■■ 4.12
ARID3CA6NKF2 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC40.76■■■■■ 4.12
ARID3CA6NKF2 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC40.76■■■■■ 4.12
ARID3CA6NKF2 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.75■■■■■ 4.11
ARID3CA6NKF2 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.74■■■■■ 4.11
ARID3CA6NKF2 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.74■■■■■ 4.11
ARID3CA6NKF2 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC40.74■■■■■ 4.11
ARID3CA6NKF2 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC40.73■■■■■ 4.11
ARID3CA6NKF2 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.73■■■■■ 4.11
ARID3CA6NKF2 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.73■■■■■ 4.11
ARID3CA6NKF2 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.71■■■■■ 4.11
ARID3CA6NKF2 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC40.71■■■■■ 4.11
ARID3CA6NKF2 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC40.71■■■■■ 4.11
ARID3CA6NKF2 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC40.7■■■■■ 4.11
ARID3CA6NKF2 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC40.7■■■■■ 4.11
ARID3CA6NKF2 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.7■■■■■ 4.11
ARID3CA6NKF2 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.69■■■■■ 4.1
ARID3CA6NKF2 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.69■■■■■ 4.1
ARID3CA6NKF2 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC40.67■■■■■ 4.1
ARID3CA6NKF2 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.67■■■■■ 4.1
ARID3CA6NKF2 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.67■■■■■ 4.1
ARID3CA6NKF2 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.67■■■■■ 4.1
ARID3CA6NKF2 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC40.67■■■■■ 4.1
ARID3CA6NKF2 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.66■■■■■ 4.1
ARID3CA6NKF2 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC40.66■■■■■ 4.1
ARID3CA6NKF2 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC40.66■■■■■ 4.1
ARID3CA6NKF2 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.66■■■■■ 4.1
ARID3CA6NKF2 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC40.65■■■■■ 4.1
ARID3CA6NKF2 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC40.64■■■■■ 4.1
ARID3CA6NKF2 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC40.63■■■■■ 4.09
ARID3CA6NKF2 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.62■■■■■ 4.09
ARID3CA6NKF2 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.62■■■■■ 4.09
ARID3CA6NKF2 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC40.62■■■■■ 4.09
ARID3CA6NKF2 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC40.6■■■■■ 4.09
ARID3CA6NKF2 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC40.6■■■■■ 4.09
ARID3CA6NKF2 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.59■■■■■ 4.09
ARID3CA6NKF2 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC40.58■■■■■ 4.09
ARID3CA6NKF2 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.58■■■■■ 4.09
ARID3CA6NKF2 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC40.58■■■■■ 4.09
ARID3CA6NKF2 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC40.57■■■■■ 4.08
ARID3CA6NKF2 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC40.56■■■■■ 4.08
ARID3CA6NKF2 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC40.55■■■■■ 4.08
ARID3CA6NKF2 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.53■■■■■ 4.08
ARID3CA6NKF2 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC40.53■■■■■ 4.08
ARID3CA6NKF2 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC40.53■■■■■ 4.08
ARID3CA6NKF2 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC40.53■■■■■ 4.08
ARID3CA6NKF2 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC40.53■■■■■ 4.08
ARID3CA6NKF2 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC40.52■■■■■ 4.08
ARID3CA6NKF2 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
ARID3CA6NKF2 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.08
ARID3CA6NKF2 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC40.51■■■■■ 4.08
ARID3CA6NKF2 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.5■■■■■ 4.07
ARID3CA6NKF2 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
ARID3CA6NKF2 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
ARID3CA6NKF2 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
ARID3CA6NKF2 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC40.49■■■■■ 4.07
ARID3CA6NKF2 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
ARID3CA6NKF2 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC40.48■■■■■ 4.07
ARID3CA6NKF2 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.48■■■■■ 4.07
ARID3CA6NKF2 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
ARID3CA6NKF2 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC40.48■■■■■ 4.07
ARID3CA6NKF2 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.48■■■■■ 4.07
ARID3CA6NKF2 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
ARID3CA6NKF2 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
ARID3CA6NKF2 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
ARID3CA6NKF2 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.46■■■■■ 4.07
ARID3CA6NKF2 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC40.45■■■■■ 4.07
ARID3CA6NKF2 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
ARID3CA6NKF2 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC40.44■■■■■ 4.06
ARID3CA6NKF2 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.44■■■■■ 4.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms