Protein–RNA interactions for Protein: A1A4G5

LNP1, Leukemia NUP98 fusion partner 1, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LNP1A1A4G5 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LNP1A1A4G5 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LNP1A1A4G5 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
LNP1A1A4G5 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LNP1A1A4G5 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
LNP1A1A4G5 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
LNP1A1A4G5 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
LNP1A1A4G5 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LNP1A1A4G5 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
LNP1A1A4G5 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LNP1A1A4G5 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LNP1A1A4G5 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LNP1A1A4G5 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LNP1A1A4G5 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LNP1A1A4G5 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LNP1A1A4G5 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LNP1A1A4G5 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LNP1A1A4G5 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LNP1A1A4G5 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LNP1A1A4G5 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LNP1A1A4G5 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LNP1A1A4G5 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LNP1A1A4G5 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LNP1A1A4G5 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LNP1A1A4G5 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LNP1A1A4G5 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
LNP1A1A4G5 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
LNP1A1A4G5 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LNP1A1A4G5 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LNP1A1A4G5 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
LNP1A1A4G5 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
LNP1A1A4G5 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LNP1A1A4G5 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LNP1A1A4G5 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LNP1A1A4G5 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LNP1A1A4G5 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LNP1A1A4G5 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LNP1A1A4G5 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LNP1A1A4G5 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LNP1A1A4G5 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LNP1A1A4G5 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LNP1A1A4G5 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
LNP1A1A4G5 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LNP1A1A4G5 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LNP1A1A4G5 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
LNP1A1A4G5 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LNP1A1A4G5 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LNP1A1A4G5 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LNP1A1A4G5 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LNP1A1A4G5 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LNP1A1A4G5 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LNP1A1A4G5 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LNP1A1A4G5 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LNP1A1A4G5 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
LNP1A1A4G5 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LNP1A1A4G5 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LNP1A1A4G5 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LNP1A1A4G5 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LNP1A1A4G5 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LNP1A1A4G5 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LNP1A1A4G5 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
LNP1A1A4G5 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LNP1A1A4G5 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LNP1A1A4G5 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LNP1A1A4G5 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LNP1A1A4G5 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
LNP1A1A4G5 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LNP1A1A4G5 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LNP1A1A4G5 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
LNP1A1A4G5 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
LNP1A1A4G5 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
LNP1A1A4G5 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LNP1A1A4G5 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LNP1A1A4G5 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LNP1A1A4G5 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LNP1A1A4G5 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LNP1A1A4G5 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LNP1A1A4G5 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LNP1A1A4G5 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LNP1A1A4G5 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LNP1A1A4G5 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LNP1A1A4G5 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LNP1A1A4G5 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LNP1A1A4G5 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
LNP1A1A4G5 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LNP1A1A4G5 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LNP1A1A4G5 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LNP1A1A4G5 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LNP1A1A4G5 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
LNP1A1A4G5 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LNP1A1A4G5 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
LNP1A1A4G5 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LNP1A1A4G5 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LNP1A1A4G5 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LNP1A1A4G5 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LNP1A1A4G5 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LNP1A1A4G5 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LNP1A1A4G5 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LNP1A1A4G5 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LNP1A1A4G5 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms