Protein–RNA interactions for Protein: A0ZSE6

TMEM30CP, Cell cycle control protein 50C, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM30CPA0ZSE6 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM30CPA0ZSE6 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM30CPA0ZSE6 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM30CPA0ZSE6 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TMEM30CPA0ZSE6 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM30CPA0ZSE6 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM30CPA0ZSE6 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM30CPA0ZSE6 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM30CPA0ZSE6 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM30CPA0ZSE6 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM30CPA0ZSE6 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM30CPA0ZSE6 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM30CPA0ZSE6 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM30CPA0ZSE6 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM30CPA0ZSE6 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM30CPA0ZSE6 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM30CPA0ZSE6 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM30CPA0ZSE6 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM30CPA0ZSE6 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM30CPA0ZSE6 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM30CPA0ZSE6 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM30CPA0ZSE6 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM30CPA0ZSE6 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM30CPA0ZSE6 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM30CPA0ZSE6 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM30CPA0ZSE6 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM30CPA0ZSE6 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM30CPA0ZSE6 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM30CPA0ZSE6 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM30CPA0ZSE6 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM30CPA0ZSE6 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM30CPA0ZSE6 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM30CPA0ZSE6 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM30CPA0ZSE6 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM30CPA0ZSE6 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM30CPA0ZSE6 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM30CPA0ZSE6 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM30CPA0ZSE6 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM30CPA0ZSE6 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM30CPA0ZSE6 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM30CPA0ZSE6 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM30CPA0ZSE6 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM30CPA0ZSE6 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM30CPA0ZSE6 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM30CPA0ZSE6 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM30CPA0ZSE6 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM30CPA0ZSE6 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM30CPA0ZSE6 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM30CPA0ZSE6 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM30CPA0ZSE6 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM30CPA0ZSE6 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM30CPA0ZSE6 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM30CPA0ZSE6 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM30CPA0ZSE6 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM30CPA0ZSE6 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM30CPA0ZSE6 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM30CPA0ZSE6 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM30CPA0ZSE6 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM30CPA0ZSE6 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM30CPA0ZSE6 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM30CPA0ZSE6 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TMEM30CPA0ZSE6 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM30CPA0ZSE6 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM30CPA0ZSE6 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TMEM30CPA0ZSE6 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM30CPA0ZSE6 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM30CPA0ZSE6 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM30CPA0ZSE6 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM30CPA0ZSE6 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
TMEM30CPA0ZSE6 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM30CPA0ZSE6 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM30CPA0ZSE6 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM30CPA0ZSE6 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM30CPA0ZSE6 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM30CPA0ZSE6 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM30CPA0ZSE6 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM30CPA0ZSE6 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM30CPA0ZSE6 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM30CPA0ZSE6 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM30CPA0ZSE6 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM30CPA0ZSE6 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM30CPA0ZSE6 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMEM30CPA0ZSE6 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
TMEM30CPA0ZSE6 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMEM30CPA0ZSE6 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMEM30CPA0ZSE6 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMEM30CPA0ZSE6 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM30CPA0ZSE6 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM30CPA0ZSE6 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM30CPA0ZSE6 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM30CPA0ZSE6 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM30CPA0ZSE6 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMEM30CPA0ZSE6 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMEM30CPA0ZSE6 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMEM30CPA0ZSE6 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMEM30CPA0ZSE6 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMEM30CPA0ZSE6 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
TMEM30CPA0ZSE6 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMEM30CPA0ZSE6 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMEM30CPA0ZSE6 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms