Protein–RNA interactions for Protein: A0AV96

RBM47, RNA-binding protein 47, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM47A0AV96 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
RBM47A0AV96 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
RBM47A0AV96 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
RBM47A0AV96 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RBM47A0AV96 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
RBM47A0AV96 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
RBM47A0AV96 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RBM47A0AV96 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RBM47A0AV96 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
RBM47A0AV96 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RBM47A0AV96 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
RBM47A0AV96 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
RBM47A0AV96 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RBM47A0AV96 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RBM47A0AV96 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
RBM47A0AV96 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RBM47A0AV96 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
RBM47A0AV96 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
RBM47A0AV96 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
RBM47A0AV96 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RBM47A0AV96 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RBM47A0AV96 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
RBM47A0AV96 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
RBM47A0AV96 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RBM47A0AV96 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RBM47A0AV96 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
RBM47A0AV96 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
RBM47A0AV96 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC29■■■□□ 2.23
RBM47A0AV96 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
RBM47A0AV96 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
RBM47A0AV96 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
RBM47A0AV96 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
RBM47A0AV96 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RBM47A0AV96 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
RBM47A0AV96 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
RBM47A0AV96 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
RBM47A0AV96 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
RBM47A0AV96 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RBM47A0AV96 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
RBM47A0AV96 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RBM47A0AV96 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
RBM47A0AV96 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RBM47A0AV96 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RBM47A0AV96 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RBM47A0AV96 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RBM47A0AV96 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
RBM47A0AV96 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
RBM47A0AV96 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
RBM47A0AV96 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
RBM47A0AV96 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RBM47A0AV96 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
RBM47A0AV96 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RBM47A0AV96 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RBM47A0AV96 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
RBM47A0AV96 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RBM47A0AV96 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
RBM47A0AV96 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
RBM47A0AV96 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
RBM47A0AV96 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RBM47A0AV96 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RBM47A0AV96 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RBM47A0AV96 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RBM47A0AV96 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RBM47A0AV96 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RBM47A0AV96 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RBM47A0AV96 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RBM47A0AV96 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RBM47A0AV96 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
RBM47A0AV96 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RBM47A0AV96 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RBM47A0AV96 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RBM47A0AV96 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RBM47A0AV96 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RBM47A0AV96 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RBM47A0AV96 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RBM47A0AV96 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
RBM47A0AV96 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RBM47A0AV96 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RBM47A0AV96 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
RBM47A0AV96 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RBM47A0AV96 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RBM47A0AV96 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RBM47A0AV96 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RBM47A0AV96 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RBM47A0AV96 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RBM47A0AV96 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RBM47A0AV96 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RBM47A0AV96 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RBM47A0AV96 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RBM47A0AV96 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RBM47A0AV96 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RBM47A0AV96 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RBM47A0AV96 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RBM47A0AV96 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RBM47A0AV96 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
RBM47A0AV96 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
RBM47A0AV96 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RBM47A0AV96 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RBM47A0AV96 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RBM47A0AV96 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.8 ms