Protein–RNA interactions for Protein: A0A1W2PQD3

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A1W2PQD3 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
A0A1W2PQD3 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
A0A1W2PQD3 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
A0A1W2PQD3 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
A0A1W2PQD3 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
A0A1W2PQD3 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
A0A1W2PQD3 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
A0A1W2PQD3 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
A0A1W2PQD3 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
A0A1W2PQD3 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
A0A1W2PQD3 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
A0A1W2PQD3 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
A0A1W2PQD3 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
A0A1W2PQD3 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
A0A1W2PQD3 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
A0A1W2PQD3 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
A0A1W2PQD3 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
A0A1W2PQD3 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
A0A1W2PQD3 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
A0A1W2PQD3 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
A0A1W2PQD3 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
A0A1W2PQD3 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
A0A1W2PQD3 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
A0A1W2PQD3 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
A0A1W2PQD3 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
A0A1W2PQD3 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
A0A1W2PQD3 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
A0A1W2PQD3 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
A0A1W2PQD3 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
A0A1W2PQD3 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
A0A1W2PQD3 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
A0A1W2PQD3 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
A0A1W2PQD3 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
A0A1W2PQD3 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
A0A1W2PQD3 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
A0A1W2PQD3 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
A0A1W2PQD3 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
A0A1W2PQD3 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
A0A1W2PQD3 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
A0A1W2PQD3 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
A0A1W2PQD3 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
A0A1W2PQD3 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
A0A1W2PQD3 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
A0A1W2PQD3 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
A0A1W2PQD3 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
A0A1W2PQD3 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
A0A1W2PQD3 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
A0A1W2PQD3 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
A0A1W2PQD3 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
A0A1W2PQD3 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
A0A1W2PQD3 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
A0A1W2PQD3 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
A0A1W2PQD3 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
A0A1W2PQD3 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
A0A1W2PQD3 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
A0A1W2PQD3 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
A0A1W2PQD3 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
A0A1W2PQD3 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
A0A1W2PQD3 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
A0A1W2PQD3 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
A0A1W2PQD3 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
A0A1W2PQD3 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
A0A1W2PQD3 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
A0A1W2PQD3 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
A0A1W2PQD3 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
A0A1W2PQD3 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
A0A1W2PQD3 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
A0A1W2PQD3 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
A0A1W2PQD3 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
A0A1W2PQD3 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
A0A1W2PQD3 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
A0A1W2PQD3 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
A0A1W2PQD3 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
A0A1W2PQD3 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
A0A1W2PQD3 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
A0A1W2PQD3 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
A0A1W2PQD3 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
A0A1W2PQD3 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
A0A1W2PQD3 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
A0A1W2PQD3 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
A0A1W2PQD3 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
A0A1W2PQD3 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
A0A1W2PQD3 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
A0A1W2PQD3 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
A0A1W2PQD3 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
A0A1W2PQD3 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
A0A1W2PQD3 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
A0A1W2PQD3 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
A0A1W2PQD3 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
A0A1W2PQD3 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
A0A1W2PQD3 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
A0A1W2PQD3 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
A0A1W2PQD3 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
A0A1W2PQD3 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
A0A1W2PQD3 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
A0A1W2PQD3 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
A0A1W2PQD3 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
A0A1W2PQD3 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
A0A1W2PQD3 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
A0A1W2PQD3 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms