Protein–RNA interactions for Protein: P99999

CYCS, Cytochrome c, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYCSP99999 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CYCSP99999 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CYCSP99999 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CYCSP99999 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CYCSP99999 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CYCSP99999 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CYCSP99999 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CYCSP99999 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CYCSP99999 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CYCSP99999 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CYCSP99999 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CYCSP99999 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CYCSP99999 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CYCSP99999 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CYCSP99999 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CYCSP99999 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CYCSP99999 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CYCSP99999 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CYCSP99999 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CYCSP99999 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CYCSP99999 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CYCSP99999 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CYCSP99999 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CYCSP99999 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CYCSP99999 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CYCSP99999 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CYCSP99999 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CYCSP99999 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CYCSP99999 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CYCSP99999 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CYCSP99999 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CYCSP99999 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CYCSP99999 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CYCSP99999 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CYCSP99999 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CYCSP99999 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CYCSP99999 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CYCSP99999 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CYCSP99999 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CYCSP99999 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CYCSP99999 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CYCSP99999 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CYCSP99999 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CYCSP99999 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CYCSP99999 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CYCSP99999 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CYCSP99999 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CYCSP99999 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CYCSP99999 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CYCSP99999 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CYCSP99999 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CYCSP99999 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CYCSP99999 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CYCSP99999 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CYCSP99999 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CYCSP99999 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CYCSP99999 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CYCSP99999 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CYCSP99999 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CYCSP99999 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CYCSP99999 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CYCSP99999 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CYCSP99999 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CYCSP99999 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CYCSP99999 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CYCSP99999 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CYCSP99999 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CYCSP99999 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CYCSP99999 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CYCSP99999 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CYCSP99999 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CYCSP99999 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CYCSP99999 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CYCSP99999 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CYCSP99999 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CYCSP99999 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CYCSP99999 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CYCSP99999 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CYCSP99999 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CYCSP99999 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CYCSP99999 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CYCSP99999 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CYCSP99999 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CYCSP99999 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CYCSP99999 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CYCSP99999 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CYCSP99999 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CYCSP99999 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CYCSP99999 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CYCSP99999 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CYCSP99999 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CYCSP99999 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CYCSP99999 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CYCSP99999 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CYCSP99999 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CYCSP99999 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CYCSP99999 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CYCSP99999 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CYCSP99999 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CYCSP99999 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms