Protein–RNA interactions for Protein: O14618

CCS, Copper chaperone for superoxide dismutase, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSO14618 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCSO14618 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCSO14618 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCSO14618 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCSO14618 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCSO14618 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCSO14618 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCSO14618 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CCSO14618 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCSO14618 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CCSO14618 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCSO14618 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCSO14618 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCSO14618 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCSO14618 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCSO14618 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCSO14618 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CCSO14618 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCSO14618 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCSO14618 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCSO14618 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCSO14618 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCSO14618 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCSO14618 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCSO14618 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCSO14618 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCSO14618 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCSO14618 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCSO14618 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCSO14618 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCSO14618 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCSO14618 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCSO14618 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCSO14618 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCSO14618 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCSO14618 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCSO14618 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCSO14618 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCSO14618 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCSO14618 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCSO14618 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCSO14618 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCSO14618 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCSO14618 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCSO14618 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCSO14618 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCSO14618 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCSO14618 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCSO14618 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCSO14618 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCSO14618 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCSO14618 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCSO14618 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCSO14618 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCSO14618 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCSO14618 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCSO14618 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCSO14618 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCSO14618 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCSO14618 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCSO14618 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCSO14618 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCSO14618 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCSO14618 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCSO14618 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCSO14618 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCSO14618 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCSO14618 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCSO14618 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCSO14618 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCSO14618 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCSO14618 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCSO14618 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCSO14618 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCSO14618 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCSO14618 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCSO14618 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCSO14618 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCSO14618 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCSO14618 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCSO14618 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCSO14618 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCSO14618 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCSO14618 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CCSO14618 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCSO14618 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCSO14618 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCSO14618 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCSO14618 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCSO14618 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCSO14618 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCSO14618 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCSO14618 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCSO14618 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCSO14618 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCSO14618 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCSO14618 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCSO14618 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCSO14618 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCSO14618 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.2 ms