Protein–RNA interactions for Protein: Q99471

PFDN5, Prefoldin subunit 5, humanhuman

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Length 154 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN5Q99471 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PFDN5Q99471 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PFDN5Q99471 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PFDN5Q99471 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PFDN5Q99471 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PFDN5Q99471 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PFDN5Q99471 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PFDN5Q99471 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PFDN5Q99471 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PFDN5Q99471 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PFDN5Q99471 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PFDN5Q99471 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PFDN5Q99471 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PFDN5Q99471 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PFDN5Q99471 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PFDN5Q99471 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PFDN5Q99471 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PFDN5Q99471 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PFDN5Q99471 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PFDN5Q99471 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PFDN5Q99471 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PFDN5Q99471 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PFDN5Q99471 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PFDN5Q99471 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PFDN5Q99471 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PFDN5Q99471 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PFDN5Q99471 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PFDN5Q99471 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PFDN5Q99471 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PFDN5Q99471 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PFDN5Q99471 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PFDN5Q99471 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PFDN5Q99471 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PFDN5Q99471 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PFDN5Q99471 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PFDN5Q99471 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PFDN5Q99471 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PFDN5Q99471 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PFDN5Q99471 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PFDN5Q99471 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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PFDN5Q99471 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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PFDN5Q99471 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PFDN5Q99471 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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PFDN5Q99471 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PFDN5Q99471 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PFDN5Q99471 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PFDN5Q99471 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PFDN5Q99471 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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PFDN5Q99471 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PFDN5Q99471 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PFDN5Q99471 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PFDN5Q99471 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PFDN5Q99471 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PFDN5Q99471 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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PFDN5Q99471 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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PFDN5Q99471 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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PFDN5Q99471 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PFDN5Q99471 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PFDN5Q99471 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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PFDN5Q99471 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PFDN5Q99471 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PFDN5Q99471 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PFDN5Q99471 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PFDN5Q99471 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PFDN5Q99471 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PFDN5Q99471 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PFDN5Q99471 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PFDN5Q99471 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PFDN5Q99471 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PFDN5Q99471 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PFDN5Q99471 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PFDN5Q99471 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PFDN5Q99471 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PFDN5Q99471 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PFDN5Q99471 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PFDN5Q99471 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PFDN5Q99471 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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