Protein–RNA interactions for Protein: Q96PE3

INPP4A, Type I inositol 3,4-bisphosphate 4-phosphatase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 977 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INPP4AQ96PE3 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
INPP4AQ96PE3 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
INPP4AQ96PE3 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
INPP4AQ96PE3 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
INPP4AQ96PE3 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
INPP4AQ96PE3 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
INPP4AQ96PE3 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
INPP4AQ96PE3 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
INPP4AQ96PE3 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
INPP4AQ96PE3 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
INPP4AQ96PE3 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
INPP4AQ96PE3 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
INPP4AQ96PE3 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
INPP4AQ96PE3 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
INPP4AQ96PE3 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
INPP4AQ96PE3 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
INPP4AQ96PE3 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
INPP4AQ96PE3 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
INPP4AQ96PE3 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
INPP4AQ96PE3 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
INPP4AQ96PE3 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
INPP4AQ96PE3 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
INPP4AQ96PE3 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
INPP4AQ96PE3 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
INPP4AQ96PE3 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
INPP4AQ96PE3 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
INPP4AQ96PE3 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
INPP4AQ96PE3 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
INPP4AQ96PE3 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
INPP4AQ96PE3 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
INPP4AQ96PE3 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
INPP4AQ96PE3 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
INPP4AQ96PE3 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
INPP4AQ96PE3 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
INPP4AQ96PE3 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
INPP4AQ96PE3 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
INPP4AQ96PE3 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
INPP4AQ96PE3 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
INPP4AQ96PE3 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
INPP4AQ96PE3 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
INPP4AQ96PE3 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
INPP4AQ96PE3 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
INPP4AQ96PE3 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
INPP4AQ96PE3 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
INPP4AQ96PE3 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
INPP4AQ96PE3 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
INPP4AQ96PE3 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
INPP4AQ96PE3 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
INPP4AQ96PE3 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
INPP4AQ96PE3 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
INPP4AQ96PE3 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
INPP4AQ96PE3 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
INPP4AQ96PE3 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
INPP4AQ96PE3 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
INPP4AQ96PE3 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
INPP4AQ96PE3 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
INPP4AQ96PE3 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
INPP4AQ96PE3 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
INPP4AQ96PE3 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
INPP4AQ96PE3 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
INPP4AQ96PE3 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
INPP4AQ96PE3 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
INPP4AQ96PE3 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
INPP4AQ96PE3 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
INPP4AQ96PE3 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
INPP4AQ96PE3 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
INPP4AQ96PE3 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
INPP4AQ96PE3 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
INPP4AQ96PE3 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
INPP4AQ96PE3 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
INPP4AQ96PE3 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
INPP4AQ96PE3 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
INPP4AQ96PE3 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
INPP4AQ96PE3 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
INPP4AQ96PE3 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
INPP4AQ96PE3 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
INPP4AQ96PE3 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
INPP4AQ96PE3 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
INPP4AQ96PE3 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
INPP4AQ96PE3 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
INPP4AQ96PE3 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
INPP4AQ96PE3 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
INPP4AQ96PE3 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
INPP4AQ96PE3 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
INPP4AQ96PE3 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
INPP4AQ96PE3 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
INPP4AQ96PE3 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
INPP4AQ96PE3 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
INPP4AQ96PE3 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
INPP4AQ96PE3 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
INPP4AQ96PE3 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
INPP4AQ96PE3 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
INPP4AQ96PE3 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
INPP4AQ96PE3 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
INPP4AQ96PE3 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
INPP4AQ96PE3 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
INPP4AQ96PE3 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
INPP4AQ96PE3 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
INPP4AQ96PE3 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
INPP4AQ96PE3 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.6 ms