Protein–RNA interactions for Protein: P59089

LINC00205, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00205, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00205P59089 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00205P59089 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00205P59089 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00205P59089 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00205P59089 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00205P59089 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00205P59089 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00205P59089 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00205P59089 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00205P59089 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00205P59089 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00205P59089 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00205P59089 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00205P59089 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00205P59089 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00205P59089 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00205P59089 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00205P59089 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00205P59089 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00205P59089 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00205P59089 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00205P59089 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00205P59089 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00205P59089 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00205P59089 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00205P59089 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00205P59089 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00205P59089 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00205P59089 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00205P59089 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00205P59089 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00205P59089 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00205P59089 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00205P59089 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00205P59089 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00205P59089 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00205P59089 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00205P59089 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00205P59089 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00205P59089 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00205P59089 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00205P59089 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00205P59089 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00205P59089 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00205P59089 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00205P59089 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00205P59089 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00205P59089 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00205P59089 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00205P59089 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00205P59089 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00205P59089 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00205P59089 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00205P59089 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00205P59089 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00205P59089 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00205P59089 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00205P59089 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00205P59089 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00205P59089 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00205P59089 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00205P59089 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00205P59089 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00205P59089 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00205P59089 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00205P59089 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00205P59089 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00205P59089 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
LINC00205P59089 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
LINC00205P59089 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
LINC00205P59089 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
LINC00205P59089 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
LINC00205P59089 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00205P59089 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00205P59089 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00205P59089 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00205P59089 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00205P59089 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00205P59089 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00205P59089 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00205P59089 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00205P59089 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00205P59089 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00205P59089 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00205P59089 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00205P59089 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00205P59089 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00205P59089 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00205P59089 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00205P59089 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00205P59089 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00205P59089 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00205P59089 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00205P59089 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00205P59089 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00205P59089 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00205P59089 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00205P59089 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00205P59089 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00205P59089 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms