Protein–RNA interactions for Protein: P53992

SEC24C, Protein transport protein Sec24C, humanhuman

Predictions only

Length 1,094 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24CP53992 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SEC24CP53992 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SEC24CP53992 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SEC24CP53992 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
SEC24CP53992 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SEC24CP53992 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SEC24CP53992 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SEC24CP53992 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SEC24CP53992 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SEC24CP53992 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SEC24CP53992 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SEC24CP53992 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SEC24CP53992 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SEC24CP53992 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SEC24CP53992 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SEC24CP53992 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SEC24CP53992 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SEC24CP53992 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SEC24CP53992 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SEC24CP53992 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SEC24CP53992 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SEC24CP53992 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SEC24CP53992 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SEC24CP53992 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SEC24CP53992 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SEC24CP53992 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SEC24CP53992 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SEC24CP53992 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SEC24CP53992 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SEC24CP53992 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SEC24CP53992 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SEC24CP53992 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SEC24CP53992 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SEC24CP53992 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SEC24CP53992 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SEC24CP53992 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SEC24CP53992 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SEC24CP53992 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SEC24CP53992 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SEC24CP53992 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SEC24CP53992 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SEC24CP53992 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SEC24CP53992 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SEC24CP53992 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SEC24CP53992 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SEC24CP53992 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SEC24CP53992 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SEC24CP53992 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SEC24CP53992 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SEC24CP53992 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SEC24CP53992 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SEC24CP53992 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SEC24CP53992 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SEC24CP53992 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SEC24CP53992 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SEC24CP53992 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SEC24CP53992 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SEC24CP53992 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SEC24CP53992 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SEC24CP53992 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SEC24CP53992 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SEC24CP53992 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SEC24CP53992 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SEC24CP53992 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SEC24CP53992 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SEC24CP53992 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SEC24CP53992 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SEC24CP53992 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SEC24CP53992 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SEC24CP53992 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SEC24CP53992 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SEC24CP53992 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SEC24CP53992 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SEC24CP53992 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SEC24CP53992 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SEC24CP53992 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SEC24CP53992 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SEC24CP53992 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SEC24CP53992 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SEC24CP53992 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SEC24CP53992 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SEC24CP53992 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SEC24CP53992 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SEC24CP53992 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SEC24CP53992 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SEC24CP53992 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SEC24CP53992 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SEC24CP53992 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SEC24CP53992 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SEC24CP53992 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SEC24CP53992 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SEC24CP53992 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SEC24CP53992 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SEC24CP53992 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SEC24CP53992 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SEC24CP53992 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SEC24CP53992 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SEC24CP53992 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SEC24CP53992 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SEC24CP53992 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
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