RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000347055.3

KRCC1-201, Transcript of lysine rich coiled-coil 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene KRCC1, Length 1,753 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRCC1-201ENST00000347055 NISCHQ9Y2I1 1504 aa36.38■■■■□ 3.41
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KRCC1-201ENST00000347055 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa30.82■■■□□ 2.52
KRCC1-201ENST00000347055 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP30.53■■■□□ 2.48
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KRCC1-201ENST00000347055 CHIC1Q5VXU3 224 aa30.22■■■□□ 2.43
KRCC1-201ENST00000347055 MYO15BQ96JP2 1530 aa30.21■■■□□ 2.43
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KRCC1-201ENST00000347055 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP28.16■■■□□ 2.1
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KRCC1-201ENST00000347055 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP28.02■■■□□ 2.08
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KRCC1-201ENST00000347055 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP27.68■■■□□ 2.02
KRCC1-201ENST00000347055 CEP162Q5TB80 1403 aa27.64■■■□□ 2.02
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KRCC1-201ENST00000347055 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa27.4■■□□□ 1.98
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KRCC1-201ENST00000347055 KIF21BO75037 1637 aa27.32■■□□□ 1.96
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KRCC1-201ENST00000347055 UNC13AQ9UPW8 1703 aa27.23■■□□□ 1.95
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KRCC1-201ENST00000347055 ERICH3Q5RHP9 1530 aa26.81■■□□□ 1.88
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KRCC1-201ENST00000347055 TOP2BQ02880 1626 aa26.77■■□□□ 1.88
KRCC1-201ENST00000347055 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa26.74■■□□□ 1.87
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KRCC1-201ENST00000347055 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa26.73■■□□□ 1.87
KRCC1-201ENST00000347055 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP26.71■■□□□ 1.87
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KRCC1-201ENST00000347055 CUX2O14529 1486 aa26.65■■□□□ 1.86
KRCC1-201ENST00000347055 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP26.63■■□□□ 1.85
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KRCC1-201ENST00000347055 CCNB3Q8WWL7 1395 aa26.31■■□□□ 1.8
KRCC1-201ENST00000347055 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP26.3■■□□□ 1.8
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KRCC1-201ENST00000347055 NCAPD3P42695 1498 aa26.17■■□□□ 1.78
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KRCC1-201ENST00000347055 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa26.1■■□□□ 1.77
KRCC1-201ENST00000347055 CFTRP13569 1480 aa26.08■■□□□ 1.77
KRCC1-201ENST00000347055 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa26.07■■□□□ 1.76
KRCC1-201ENST00000347055 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa26.06■■□□□ 1.76
KRCC1-201ENST00000347055 SETD5Q9C0A6 1442 aa26.04■■□□□ 1.76
KRCC1-201ENST00000347055 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP26.04■■□□□ 1.76
KRCC1-201ENST00000347055 CFAP43Q8NDM7 1665 aa26.03■■□□□ 1.76
KRCC1-201ENST00000347055 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa25.99■■□□□ 1.75
KRCC1-201ENST00000347055 ANP32EQ9BTT0 268 aa25.97■■□□□ 1.75
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