Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6X2

PIAS3, E3 SUMO-protein ligase PIAS3, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIAS3Q9Y6X2 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PIAS3Q9Y6X2 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
PIAS3Q9Y6X2 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PIAS3Q9Y6X2 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PIAS3Q9Y6X2 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PIAS3Q9Y6X2 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PIAS3Q9Y6X2 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PIAS3Q9Y6X2 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
PIAS3Q9Y6X2 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PIAS3Q9Y6X2 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PIAS3Q9Y6X2 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
PIAS3Q9Y6X2 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PIAS3Q9Y6X2 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PIAS3Q9Y6X2 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PIAS3Q9Y6X2 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PIAS3Q9Y6X2 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PIAS3Q9Y6X2 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PIAS3Q9Y6X2 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PIAS3Q9Y6X2 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
PIAS3Q9Y6X2 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PIAS3Q9Y6X2 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PIAS3Q9Y6X2 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PIAS3Q9Y6X2 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PIAS3Q9Y6X2 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PIAS3Q9Y6X2 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PIAS3Q9Y6X2 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PIAS3Q9Y6X2 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PIAS3Q9Y6X2 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PIAS3Q9Y6X2 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PIAS3Q9Y6X2 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PIAS3Q9Y6X2 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PIAS3Q9Y6X2 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PIAS3Q9Y6X2 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
PIAS3Q9Y6X2 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PIAS3Q9Y6X2 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PIAS3Q9Y6X2 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PIAS3Q9Y6X2 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PIAS3Q9Y6X2 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
PIAS3Q9Y6X2 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PIAS3Q9Y6X2 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PIAS3Q9Y6X2 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PIAS3Q9Y6X2 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PIAS3Q9Y6X2 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PIAS3Q9Y6X2 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PIAS3Q9Y6X2 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PIAS3Q9Y6X2 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PIAS3Q9Y6X2 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PIAS3Q9Y6X2 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PIAS3Q9Y6X2 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PIAS3Q9Y6X2 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PIAS3Q9Y6X2 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PIAS3Q9Y6X2 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PIAS3Q9Y6X2 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PIAS3Q9Y6X2 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PIAS3Q9Y6X2 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PIAS3Q9Y6X2 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PIAS3Q9Y6X2 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PIAS3Q9Y6X2 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PIAS3Q9Y6X2 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PIAS3Q9Y6X2 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PIAS3Q9Y6X2 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PIAS3Q9Y6X2 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PIAS3Q9Y6X2 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
PIAS3Q9Y6X2 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PIAS3Q9Y6X2 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PIAS3Q9Y6X2 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PIAS3Q9Y6X2 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PIAS3Q9Y6X2 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PIAS3Q9Y6X2 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PIAS3Q9Y6X2 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PIAS3Q9Y6X2 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PIAS3Q9Y6X2 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
PIAS3Q9Y6X2 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PIAS3Q9Y6X2 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PIAS3Q9Y6X2 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PIAS3Q9Y6X2 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PIAS3Q9Y6X2 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PIAS3Q9Y6X2 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PIAS3Q9Y6X2 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PIAS3Q9Y6X2 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
PIAS3Q9Y6X2 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PIAS3Q9Y6X2 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PIAS3Q9Y6X2 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PIAS3Q9Y6X2 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PIAS3Q9Y6X2 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PIAS3Q9Y6X2 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PIAS3Q9Y6X2 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PIAS3Q9Y6X2 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PIAS3Q9Y6X2 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PIAS3Q9Y6X2 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PIAS3Q9Y6X2 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PIAS3Q9Y6X2 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PIAS3Q9Y6X2 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
PIAS3Q9Y6X2 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
PIAS3Q9Y6X2 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PIAS3Q9Y6X2 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PIAS3Q9Y6X2 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PIAS3Q9Y6X2 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PIAS3Q9Y6X2 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PIAS3Q9Y6X2 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms