Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6G3

MRPL42, 39S ribosomal protein L42, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL42Q9Y6G3 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
MRPL42Q9Y6G3 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
MRPL42Q9Y6G3 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
MRPL42Q9Y6G3 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
MRPL42Q9Y6G3 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
MRPL42Q9Y6G3 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
MRPL42Q9Y6G3 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
MRPL42Q9Y6G3 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
MRPL42Q9Y6G3 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
MRPL42Q9Y6G3 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
MRPL42Q9Y6G3 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
MRPL42Q9Y6G3 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
MRPL42Q9Y6G3 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
MRPL42Q9Y6G3 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
MRPL42Q9Y6G3 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
MRPL42Q9Y6G3 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
MRPL42Q9Y6G3 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
MRPL42Q9Y6G3 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
MRPL42Q9Y6G3 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
MRPL42Q9Y6G3 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
MRPL42Q9Y6G3 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
MRPL42Q9Y6G3 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
MRPL42Q9Y6G3 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
MRPL42Q9Y6G3 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
MRPL42Q9Y6G3 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
MRPL42Q9Y6G3 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
MRPL42Q9Y6G3 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MRPL42Q9Y6G3 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MRPL42Q9Y6G3 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
MRPL42Q9Y6G3 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
MRPL42Q9Y6G3 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
MRPL42Q9Y6G3 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
MRPL42Q9Y6G3 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
MRPL42Q9Y6G3 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
MRPL42Q9Y6G3 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
MRPL42Q9Y6G3 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
MRPL42Q9Y6G3 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
MRPL42Q9Y6G3 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
MRPL42Q9Y6G3 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
MRPL42Q9Y6G3 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
MRPL42Q9Y6G3 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
MRPL42Q9Y6G3 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
MRPL42Q9Y6G3 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
MRPL42Q9Y6G3 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
MRPL42Q9Y6G3 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
MRPL42Q9Y6G3 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
MRPL42Q9Y6G3 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
MRPL42Q9Y6G3 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
MRPL42Q9Y6G3 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
MRPL42Q9Y6G3 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
MRPL42Q9Y6G3 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
MRPL42Q9Y6G3 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
MRPL42Q9Y6G3 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
MRPL42Q9Y6G3 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
MRPL42Q9Y6G3 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
MRPL42Q9Y6G3 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
MRPL42Q9Y6G3 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
MRPL42Q9Y6G3 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
MRPL42Q9Y6G3 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
MRPL42Q9Y6G3 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
MRPL42Q9Y6G3 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
MRPL42Q9Y6G3 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
MRPL42Q9Y6G3 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
MRPL42Q9Y6G3 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MRPL42Q9Y6G3 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
MRPL42Q9Y6G3 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
MRPL42Q9Y6G3 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
MRPL42Q9Y6G3 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
MRPL42Q9Y6G3 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
MRPL42Q9Y6G3 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
MRPL42Q9Y6G3 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
MRPL42Q9Y6G3 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
MRPL42Q9Y6G3 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
MRPL42Q9Y6G3 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
MRPL42Q9Y6G3 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
MRPL42Q9Y6G3 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
MRPL42Q9Y6G3 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
MRPL42Q9Y6G3 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
MRPL42Q9Y6G3 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
MRPL42Q9Y6G3 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MRPL42Q9Y6G3 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
MRPL42Q9Y6G3 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
MRPL42Q9Y6G3 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MRPL42Q9Y6G3 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
MRPL42Q9Y6G3 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
MRPL42Q9Y6G3 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
MRPL42Q9Y6G3 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
MRPL42Q9Y6G3 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
MRPL42Q9Y6G3 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
MRPL42Q9Y6G3 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
MRPL42Q9Y6G3 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
MRPL42Q9Y6G3 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
MRPL42Q9Y6G3 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
MRPL42Q9Y6G3 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
MRPL42Q9Y6G3 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
MRPL42Q9Y6G3 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
MRPL42Q9Y6G3 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
MRPL42Q9Y6G3 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
MRPL42Q9Y6G3 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
MRPL42Q9Y6G3 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms